其他各部首领看见这种情况后也心胆俱丧，无心再战，纷纷策马逃离战场。
眼见叶赫部首领卜寨被杀，九部联军溃散，努尔哈赤命令吹响螺号。刹那间，伏兵四起，古勒山上的铁骑，像雪崩，像山洪，直冲下来；建州军如野兽，如猛虎，直向联军扑来。一时间，骑涛呼啸，鬼哭狼嚎，刀光剑影，人仰马翻，血注如洪，兵马填江。
侥幸逃走的全部挤在古勒山与浑河之间狭窄的小路上，人多反坏事，联军被踩死、被挤落水溺死的比被杀死的还多。
这场惊心动魄的大战，就是著名的古勒山之战。
在这场战役中，努尔哈赤军斩杀叶赫部首领卜寨及联军四千余人，俘虏乌拉部首领的弟弟布占泰，缴获战马三千匹、铠甲千副。
这一仗彻底奠定了努尔哈赤在建州以及整个女真族的地位，努尔哈赤从此威名大振，远近慑服。
古勒山之战，也成了女真各部统一战争史的转折点。它打破九部军事联盟，改变建州女真和海西女真的力量对比，成为扈伦四部灭亡的决定点。
制度要不断进步：牛录的诞生
战争过后就是建设。双方都没有原地满血复活的绝招，所以都只能在元气大伤之后躺在家里医治创伤。
击败九部联军固然是一场意义重大的胜利，但是有野心的人绝不甘于已经拥有的，而是时刻关注着还未到手的那部分。
在这一场大胜之后，努尔哈赤没有像大多数统帅一样大肆封官割地、赏财发物。他清楚地知道外界的形势和自己的目标——他已把眼光放在了海西女真和野人女真的身上。你们能打过来，我就能打过去。
但是对付海西女真不是努尔哈赤未来的唯一工作，因为他发现，自己的部队就是一个矛盾重重的综合体，以这样一个矛盾的综合体去吞并更多的部落，危机四伏，而且即使打赢了，也只是增添更多的矛盾。所以他的当务之急是找到问题，解决矛盾。
而叶赫部虽然在这次九部联军的战斗里损失惨重，但它长期雄踞海西，体力恢复只是时间的问题。所以要想统一女真，努尔哈赤还欠缺很多，主动进攻可不是以逸待劳，它需要更强大的实力。
发现问题，才能解决问题。眼下最为迫切的两个问题，一个是民政，一个是军政。
问题之一：这些年来地盘扩大很快，很多小部落被兼并。虽然自己在佛阿拉城称王了，但也只不过是当时的一个权宜之计，好让部下安心地跟着自己混；当时发布的一些规定都是匆忙之间下达的，执行起来大多是一句空话。所以到现在也没有一个正式的政权去管束手下的那些部落。他们想来就来，想走就走，不仅不利于生产，而且对社会的安定还有负面影响。
问题之二：归顺后的部落军队，统领权依然在原来的部落首领手中，命令由这些首领下达。这就容易出现尾大不掉、军队难以指挥的问题。在这个问题上，努尔哈赤有刻骨铭心的教训。万历十三年（1585年），努尔哈赤率领八十人，遭遇巴尔达等五个城主率领的八百人，形势相当危险，而族兄弟扎亲、桑古哩却解甲避战，其他七十多人也观望不前，努尔哈赤无计可施，只能凭四人之力冲锋陷阵，才大难不死。
这两个问题，是努尔哈赤坚持两手抓，且两手都要硬的问题，因为在战争年代，民政和军政不分家，民政是军政的大后方。
实践决定认识，物质决定意识。努尔哈赤所学文化不多，常年的打打杀杀的生涯决定了他只能从身边的实例中寻求解决办法。
女真原有的社会组织是族和寨的两种形式。“族”满语为“穆昆”，是按血缘关系由亲族本姓组成的群体。“寨”满语称“嘎山”，是按地缘关系组成的社会群体。
女真原始狩猎时，不论人数多少都以族寨而行。为了便于管束，每次打猎时，十人为一组，各出箭一支，其中一人为首领，九个人跟着。这就是牛录（即“大箭”的意思）制度，首领称作牛录额真（即“首领”之意）。当年投降努尔哈赤的鄂尔果尼就获得了一个额真的职位。由于居住部落大小不等，人数众寡不一，加上随时有他处部落或个人归附，每个牛录的人数也不尽相同，少则是五六人，多则三四十人。
努尔哈赤以女真传统的牛录组织为蓝本，进行适当改造，变成了适应当时战场需要的一种全新的组织形式：一个军民合一的奴隶制集权政体。
到万历二十三年（1595年），努尔哈赤统兵已经上万。他把部落的人按照牛录的办法统一规划，按所使用的武器和技能分为四种：环刀军、铁、串赤军、能射军。每军配有旗帜，旗色很杂，大体以青、黄、白、黑、红为主，旗上的图案也杂，或画龙，或画马，或画一些认不出的动物。不过旗帜的规格统一：宽二幅，长二尺。这就是后来八旗制的前身。
军事将领由在城中的各部首领充任，以一年为限期，任期满了就更换。守城的兵车由各个部落临时调用，以十天为限期，期满了就换班。有啥情况了还是老办法，传箭为令，所以拿根鸡毛当令箭在这会儿还是行得通的。每个兵卒自备军粮、武器，到指定的地点集中。部落里的男子一个个都上得了战场，下得了田地。平日是农民，战时是士兵。
历史上，有很多“兵民合一”的政策都和牛录类似。三国曹操就干过“士兵屯田” 的事，金朝（不是努尔哈赤创立的后金）的“猛安谋克制”简直就是“牛录”的原始文件。一般情况下，采用这种办法都是没有办法的办法，它之所以存在都是因为外部环境的恶劣导致的。
外部环境有自然环境和社会环境。女真最初采用牛录是自然原因，不这样把大家组织起来打猎，大家就会饿死。努尔哈赤采用牛录是社会原因，战争太多，经济太落后。如果养一批职业军人，那没人下地生产，就有可能会饿死；如果不备常设军队，那敌人突袭，就有可能被砍死。另外以他的见识也不可能想出新方法来。所以发扬发扬传统，把现有的改善改善就是好的。大家只好全部当农民，也全部当士兵。当农民锻炼了身体，刚好打仗派得上用场。
努尔哈赤切身地体会到，此时手下的部将就像提线木偶，完全听从自己的调遣。他可以随时动员全部的人口，也可以清楚地知道自己的进账和支出，准确地掌握自己手头到底有多少头牛、多少匹马以及多少个部落。更令他得意的是，他的这种部门领导负责制使手下那些原本自私的部落首领不敢不听从指挥。
从此，建州军赏罚分明，战斗力日益增强，这一切为努尔哈赤进军东海女真与海西女真，做好了军事准备。
远交近攻的公关政策
努尔哈赤一方面努力地使松散的建州凝聚成一个完整的集体，另一方面，他也没有忘记自己的目标和对手。
明廷和朝鲜是最大的威胁，但他们内部问题很多，只要给点东西，说些好话，基本的和平能够保证。
蒙古和乌拉离自己比较远，如果他们不和叶赫部联合，也是可以拉拢的，最好的办法就是联姻。
剩下的就是叶赫部，这个自己短时期内最大的敌人，一定要想办法消灭。努尔哈赤对诸部将说：砍倒一棵大树，不可能一下子就砍倒，必须用斧头慢慢地削它的根部，等到大树根变细了，就能一下子砍断了，我们应该像砍树一样消灭对手。
于是，远交与近攻的雏形就这样诞生了：安抚明廷和朝鲜，联合乌拉和蒙古，进攻叶赫及其追随者。
半生俯首明政府
在努尔哈赤打败九部联军之后，他迫切地想要知道明廷的态度。他知道，即使明廷像流言说的那样腐败，或者还要更腐败一些，他也无力抗衡。瘦死的骆驼比马大，这个道理他懂。明廷要是放弃了对自己的支持，自己就结束了。
此外，他还存在一丝念头想了解明朝的国内究竟是什么状态，大胜带来的野心让他开始对明朝的江山有了一点点的憧憬。
努尔哈赤竭力表示忠于明朝皇帝，甘愿当明朝的臣子，永远不会反叛。不止嘴上说，手上他也做。
第一，不抢劫、不偷盗明朝的财产；
第二，以前抢过来的人都送回明朝；
第三，申请出军队帮明朝打日本人；
第四，搞好和明朝军官的关系。
一个小小的明朝游击将军，他尊称为“游府老爷”。
对于李成梁，他更是百般迎合，屡送厚礼，甚至把弟弟舒尔哈齐的女儿嫁给李成梁的儿子李如柏为妾。当时人称努尔哈赤就像李成梁的儿子一样（有心的人会在此处心里打起一个惊叹号，努尔哈赤与李成梁天衣无缝的唱和绝非空穴来风）。
