普京被誉为政治黑马不是偶然，渐渐获得叶利钦信任的他一步步走向权利的中心，挑战与机遇并存，为了捍卫叶利钦，普京果断出击，让叶利钦的政治对手如芒在背，不得安宁。
1999年3月，普京在联邦安全局局长的位子上只干了十个月，就被叶利钦提升为俄罗斯联邦安全委员会秘书，这是一个全新的机构，由总统任命并且直属于总统，它的主要职能是：审议重要的国家和社会安全建设，制定统一的国家安全政策。联邦安全委员会下设若干跨部门委员会，包括对外政策、跨地区、国际安全、边防安全和经济安全等委员会。这是一个超级的权力机构，职权远比内阁大，因为它包括了上下两院的议长，其制定的政策都是关乎国家安全的大事。
普京担任这个要职，说明他已经进入了权力核心，成为参与决策的大员，而在此之前，他只是一个部门的负责人。
普京担任联邦安全委员秘书是其政治生涯的一个重大转折，此时叶利钦的总统任期只有一年多时间了，叶利钦长期以来身体欠佳，媒体又经常报道他酗酒失态。叶利钦身边的人，如他的女儿季亚琴科和尤马舍夫等人，在决策中所起的作用也常常引起批评。同时，俄国的经济和社会问题丛生，政坛斗争激烈。在国外，北约绕过联合国，对南斯拉夫和科索沃发动了78天的远距离空中打击，南斯拉夫被迫从科索沃撤军。
但是普京上任伊始，就显示出了铁腕政治家的本色。在科索沃问题上，当北约军队兴高采烈准备进驻科索沃首府普里什蒂纳的时候，一支俄军伞兵小分队却在英军之前，在普里什蒂纳机场如神兵天降，抢占了机场。消息传出，北约震惊。北约盟军总司令美国上将克拉克命令英军夺回机场，但是英军司令杰克逊拒绝了，他说：“将军，我不能为您而发动第三次世界大战”。有理由相信，在协调这一行动的时候，普京作为联邦安全委员秘书，也发挥了他的作用。
从1999年初开始，叶利钦的日子变得越发艰难，叶利钦陷入了腹背受敌、内外交困的局面。
俄罗斯国家杜马弹劾委员会从1998年开始就在征集弹劾总统的签名，叶利钦虽然以连换总理的对策瓦解对方势力，但弹劾事件依然不断升级。1999年2月，俄罗斯杜马通过了对叶利钦的多条指控，并提交杜马理事会审议。3月16日，杜马理事会通过决议，于4月15日的杜马全体会议上就弹劾总统问题进行正式表决。而按有关法律的规定，这5项指控只要有1项得以通过，叶利钦就将被免除总统职务。在此之前，叶利钦已4次受到弹劾威胁，但毫无疑问，这将是他最有可能被弹劾的一次。
他们指责叶利钦背叛国家，辜负人民的期待，要求叶利钦下台接受审判，而同时叶利钦与总理普里马科夫的矛盾愈演愈烈，普里马科夫甚至要求叶利钦签署声明，自愿放弃宪法规定的部分总统权力。总检察长尤里·斯库拉托夫与叶利钦的不和也凸显出来，争执不断。
此时的叶利钦已经十分“疲倦”，加上健康状况恶化，明显有些力不从心，从这时起，他开始考虑接班人的问题了，而普京就在他考虑的人选之列。
叶利钦的政敌准备给叶利钦致命一击，1991初，俄罗斯总检察长斯库拉托夫指控叶利钦的亲信别列佐夫斯基和女儿塔季雅娜涉嫌经济犯罪，下令展开调查，叶利钦决定解除斯库拉托夫的职务，但是他的决定在俄罗斯议会上院联邦委员会未被通过。一时间，叶利钦及其家人陷入了极其尴尬的境地。
此时俄罗斯的都难免陷入一个进退两难的状况——那就是选择站在谁的一边，一边是身体恶化，似乎被架空的总统，一边是咄咄逼人的总理以及国家杜马。无数的投机政客权衡着利益的得失，举棋不定。
普京没有任何的犹豫，从叶利钦不再追究他营救自己老师的事情开始，他已经成为了叶利钦的忠实部下。
他现在就一个念头，一定要让叶利钦转危为安，作为一名特工，一名军人，逃避不是他的风格，他要做的就是给敌人迎头痛击。
就在这个时候，事情出现了转机。3月16日，俄罗斯电视台播放了一段酷似斯库拉托夫的人同妓女鬼混的录像。很显然，这件事情的曝光与普京领导下的特工不无关系，普京又立下了奇功一件，这让斯库拉托夫声望大损。而在1999年4月的一次新闻发布会上，普京甚至明确指责尤里·斯库拉托夫不能毫无私心地履行总检察长的义务，以至于让这一职务的诚信和尊严遭到玷污。
老师的惨痛教训，让普京对待政治敌人毫不留情，这盘“召妓录像带”曝光后，斯库拉托夫立即被指控接受别人的性贿赂，从而放弃对某些犯罪行为进行调查。调查人员还找到了录像带上的两名妓女，她们都承认曾向斯库拉托夫提供过性服务，但钱却是别人付的。其中一名妓女承认，在有人付给她1万美元的条件下，她同意偷偷拍摄她与斯库拉托夫的床上镜头。
当时，叶利钦要求立即解除斯库拉托夫的职务，但遭到了俄国家杜马的坚决反对，俄国家杜马称，斯库拉托夫是因为调查某些官员的贪污腐败问题，才遭到了一些人的报复。直到普京上台后的2000年4月份，俄国家杜马才应普京之请，最终解除了斯库拉托夫的总检察长职务。
激烈的政治厮杀和真刀真枪的碰撞，敌人的鲜血成染红了最终胜利者的皇冠，普京的主动出击让叶利钦终于站稳了脚跟，对于此时的叶利钦来说，普京已经成为他身边不可缺少的一名虎将，普京在克林姆林宫里起到的作用也越来越明显。
普京法则：
逃避停止不了战争，害怕只让我们失去更多，面对政敌的咄咄逼人，普京没有丝毫犹豫，他像毒蛇一样，狠狠地咬住了对手的喉咙，不给他们任何机会。
在生死关头，逃避没有任何的意义，对手想方设法想消灭你，跪地求饶抑或疲于奔命都没有任何的意义，唯一的方法就是以牙还牙，以眼还眼。
小贴士：
连换总理的对策：叶利钦在一年之内换了三个总理，而在叶利钦的任期内，八年里叶利钦换了七个总理，七个安全局长，十个财长，六个内政部长，七个总统办公厅主任，六个安全会议秘书，只有外交部长和国防部长换得少些，各换了三个。
普里马科夫：普里马科夫是在叶利钦对切尔诺梅尔金两次总理提名均未通过的情况下由中立党派提出的并为各方所接受的折衷人物。因此，叶利钦选择普里马科夫纯属在个人权力地位空前虚弱情况下的无奈之举。
而普里马科夫在组阁中吸收了包括俄共在内的大量中左翼人士加入，并积极主张进行面向社会的市场经济改革，强调国家对经济的宏观调控，这些又显然是与叶利钦的政策背道而驰的。
此外，普里马科夫在一系列重大问题上还开始与叶利钦唱对台戏。1999年初，普里马科夫曾要求叶利钦签署自愿放弃宪法规定部分权利的声明，这被叶看作是普里马科夫为削弱自己权力地位而采取的一大措施，因而十分不满。
