2．料理军务。齐末，萧衍于雍州起兵伐东昏侯，车骑谘议参军张弘策随萧衍东伐。“及郢城平，萧颖达、杨公则诸将皆欲顿军夏口，高祖以为宜乘势长驱，直指京邑，以计语弘策，弘策与高祖意合。又访宁远将军庾域，域又同。乃命众军即日上道，缘江至建康，凡矶、浦、村落，军行宿次、立顿处所，弘策逆为图测，皆在目中。义师至新林，王茂、曹景宗等于大航方战，高祖遣弘策持节劳勉，众咸奋厉。是日，仍破朱雀军。高祖入顿石头城，弘策屯门禁卫，引接士类，多全免。城平，高祖遣弘策与吕僧珍先入清宫，封检府库。”从这段引文至少可以看到谘议参军弘策的如下几点。第一，参与谋划，即建议高祖立即乘胜长驱，直指京邑。第二，在食宿上，为军队在向建康的行军中，预先做了及时周到的安排。第三，犒劳将士，激励士气。第四，负责石头城的安全，保护齐政权中愿意投萧衍军队的士人。第五，清检宫城，封检府库。第六，保护建康城内的财宝。
3．插手行政事务。谘议参军本属军府僚佐，参与军政事务是情理之中的事，州行政事务理应由州行政官吏来办理。但在战火不熄的年代，军政压倒一切，于是军府的权力之手也就包揽了一切。谘议参军插手行政也就顺理成章。如元嘉七年（430年）宋军北伐，以失败而告终。当时宋、魏两军交战的兖豫之地，土境荒毁，人民凋散，城郭颓败，盗贼公行。旧芍陂良田万余顷，堤？久坏，秋夏常苦旱。时任豫州刺史的刘义欣，“遣谘议参军殷肃循行修理。有旧沟引鮯水入陂，不治积久，树木榛塞。肃伐木开榛，水得通注，旱患由是得除”。从上述谘议参军的职掌情况来看，在南朝时期这一职务大体成为一个机动职位，其职事随着州府的需要而随机变动。
四州军府其他重要参佐
东晋南朝时期，州军府佐吏中，除长史、司马、谘议参军等重要参佐之外，还有部分参佐在当时也很活跃。
（一）中兵参军
《北堂书钞》卷69引干宝《司徒仪》云：“中兵参军掌督帐内牙门将及军器，给其事。中兵之任，凡在军者各于赤录，以时科其器械，稽其人兵，身上除死及老，所以罚奸诈，均劳赏也。”此文所记乃公府之职，然而随着州郡军府纷纷建立和中兵参军的设置，其在州郡军府的基本职掌，与在公府中的职掌也就没有什么区别。但是由于魏晋南北朝时期是一个战火不断的时代，中兵的职掌也相应的有所扩展。
1．带兵参战。中兵的最初职掌只是主管帐内兵将、兵器、兵籍之属。东晋南朝时期则纷纷统兵征战，且成为其主要职责。如宋大明二年（458年），魏主拓跋轈遣军寇清口，时任青冀二州刺史的颜师伯，遣中兵参军苟思达与台军配合抵御魏军。后来魏军又遣青州刺史张怀之屯据济岸，“师伯又遣中兵参军江方兴就傅乾爱（清口戍主）击破之”。元徽二年（474年），江州刺史桂阳王休范举兵逼朝廷，晋熙王燮“遣中兵参军冯景祖袭寻阳，休范留中兵参军毛惠连、州别驾程罕之居守……”最能说明中兵参军是当时统兵作战主力的，是宋后废帝元徽五年（477年）十一月，荆州刺史沈攸之起兵反萧道成。十二月十二日，沈攸之遣兵五路二十支，其中中兵参军为军主的，就有辅国将军、中兵参军孙同，率宁朔将军中兵参军武宝、龙骧将军中兵参军王道起等为前锋。又遣辅国将军中兵参军王灵秀、辅国将军中兵参军丁珍东，率宁朔将军中兵参军王珍之，相继俱下。攸之自率辅国将军中兵参军沈韶、宁朔将军中兵参军皇甫贤、宁朔将军中兵参军胡钦之、龙骧将军中兵参军东门道顺到夏口。后又遣中兵参军公孙方平马步三千向武昌。共十一支。五路大军中，除两路由司马和沈攸之指挥外，其余三支皆由中兵参军加军号率领。而萧道成所派二十一位将领中，犹有三位中兵参军。
齐梁陈三代，中兵参军作为州军府的重要参佐依然经常统兵出征或镇守。如齐建元二年（480年），魏军寇司、豫二州，豫章王萧嶷表遣南蛮司马崔慧景北讨，“又分遣中兵参军萧惠朗援司州，屯西关”。梁简文帝大宝元年（550年），豫章内史庄铁据郡反，时江州刺史寻阳王大心“令中兵参军韦约等将军击之，铁败绩，又乞降”。陈骆牙，武帝永定三年（559年），“除安东府中兵参军，出镇冶城。寻从世祖拒王琳于南皖”。
2．兼领军府其他职务。中兵参军除在军府中统兵作战外，有时还兼领府中其他曹事。如宋申谟，大将军彭城王义康出镇豫章，谟为中兵参军，“掌城防之任”。张欣泰，齐武帝永明八年（490年）为随王子隆镇西中兵，改领河东内史。“子隆深相爱纳，数与谈宴，州府职局，多使关领……”梁时张齐，为南兖州刺史张稷中兵参军，“始委以军旅”。刘垣，“南康王为荆州刺史，垣为西中郎中兵参军，领长流”。郑绍叔，“高祖临司州，命为中兵参军，领长流”。席阐文，“复历西中郎中兵参军，领城局”。
3．领郡守、内史。中兵参军在东晋南朝时期也常领掌郡国太守内史之职。如宋王玄谟，“元嘉中，补长沙王义欣镇军中兵参军，领汝阴太守”。沈庆之，两为广陵王诞北中郎中兵参军，先领南东平太守，后加建威将军、南济阴太守。刘延孙，为“世祖抚军、广陵王诞北中郎中兵参军、南清河太守”。齐张欣泰，“（齐武帝）永明八年（490年），出为镇军中兵参军、南平内史”。曹景宗，“齐鄱阳王锵为雍州，复以为征虏中兵参军，带冯翊太守……”
4．带县令。南朝时期中兵参军亦有少数兼带县令者。如宋末韩幼宗为南中郎将、湘州刺史、南阳王岁羽中兵参军，带临湘令。荀伯玉，“太祖（萧道成）为南兖州，伯玉转为上镇军中兵参军，带广陵令”。齐永明五年，萧轈明为龙骧将军、安西中兵参军，带松滋令。陈文帝天嘉三年（562年）“始兴王伯茂出镇东州，复以文季为镇东府中兵参军，带剡令”。
中兵参军在军府中，若与长史、司马相比，属于一般佐吏，但也有发动兵变的能力，不可小觑。《梁书》卷9《王贞秀传》载，王贞秀因居丧无礼，朝廷下诏徙留广州，“乃潜结仁威府中兵参军杜景，欲袭州城，刺史萧昂讨之”。
（二）记室参军
记室之职，据考证出现在东晋中叶。一般情况下，记室参军只设在有都督衔的州军府中，监、督以下州军府通常不置记室。“宋太宗已来，皇子、皇弟虽非都督，亦置记室参军。”入梁以后，又置中记室，位居记室之上。不久又增限内、限外记室。记室之下又置记室掾。这一机构的不断扩展，表明其在军府中的地位不断增加。
记室职掌。《北堂书钞》卷69引干宝《司徒仪》曰：“记室之职，凡掌文墨章表启奏，吊贺之礼则题署也。”“记室主书议，凡有表章杂记之书，掌创其草。”干宝所记虽为公府记室职掌，但州府记室所主之事也与此无异。如宋“高祖登庸之始，文笔皆是记室参军滕演”。孔觊，被转任为荆州刺史、衡阳王义季安西府记室时，奉蕂辞曰：“记室之局，实惟华要，自非文行秀美，莫或居之。”说明要任记室参军之职，写不出好文章是不能胜任的，这正与其职掌有关。前废帝景和元年（465年），江州行事邓琬鼓动叛乱时，“使记室参军荀道林造檄文，驰告远近”。齐孔稚皀，“太祖为骠骑，以稚皀有文翰，取为记室参军，与江淹对掌辞笔”。梁刘？，“稍迁湘东王记室参军，又转中记室。太清中，侯景乱，世祖承制上流，书檄多委？焉……”赵知礼，陈高祖引为记室参军，“知礼为文赡速，每占授军书，下笔便就，率皆称旨”，都说出了记室的职掌。不过南朝时期记室参军在履行其基本职掌的同时，也贴带了不少其他职务，其中在州行政方面：
1．兼领别驾、带郡丞。陈徐伯阳，“及新安王为南徐州刺史，出镇北新安王府中记室参军，兼南徐州别驾，带东海郡丞”。
2．兼带郡守。宋张畅，为“江夏王义恭征北记室参军、晋安太守。又为义季安西记室参军、南义阳太守……”江智渊，“随府转司空主簿、记室参军，领南濮阳太守”。何佟之，“齐建武中，为镇北记室参军，侍皇太子讲，领丹阳邑中正”。
3．兼带县令。梁沈约，为蔡兴宗征西府记室参军，带厥西令。周舍，“寻为后军记室参军、秣陵令”。江革，建安王为雍州刺史，“以革为征北记室参军，带中庐令”。
4．兼州军府职。宋初傅亮，“为刘毅抚军记室参军，又补领军司马”。梁韦粲“及（晋安）王迁镇雍州，随转记室，兼中兵如故”。
5．兼任内官。南朝时期作为州军府佐吏，比较多的兼任朝廷内官还数记室参军。如兼中书通事舍人。梁傅岐，“入兼中书通事舍人，迁宁远岳阳王记室参军，舍人如故。……俄复为舍人，累迁安西中记室，镇南谘议参军，兼舍人如故”。孔子祛，“……又云麾庐江公记室参军，转兼中书通事舍人”。殷不害，“大同五年（539年），迁镇西府记室参军，寻以本官兼东宫通事舍人”。还有兼博士的，梁严植之，“天监六年（507年），迁中抚军记室参军，犹兼博士。”兼学士的，陈张讥，“高宗世，历建安王府记室参军，兼东宫学士，转武陵王限内记室，学士如故”。沈不害，陈文帝“天嘉初，除衡阳王府中记室参军，兼嘉德殿学士”。兼助教的。王元规，“天嘉中……转镇东鄱阳王府记室参军，领助教如故”。兼太常丞的。许亨，“太清初，为征西中记室，兼太常丞”。兼通直散骑常侍的。徐陵，“寻迁镇西湘东王中记室参军。太清二年（548年），兼通直散骑常侍”。
不过，南朝时期尽管记室参军经常兼领许多其他职务，而它本身却也经常被将军、外兵参军、谘议参军、行参军、中录事参军等别职兼领。
记室参军职掌的这些变化，大都发生在梁以后。实际上早在宋末，记室参军已逐渐摆脱了文记之事，成为州府中谈客们的一种荣崇之职。《南史》卷24《王纶之传》载：“为安成王记室参军，偃仰召会，退居僚末。司徒袁粲闻而叹曰：‘格外之官，便今日为重。’贵游居此位者，随以不掌文记为高，自纶之始也。”梁陈时期，记室参军开始兼职内官，可能正与这种变化有关。
（三）典签
南朝时期在州军府佐吏中，还有一种重要参佐--典签，对南朝的政治、监察曾产生过一定的影响。鉴于典签制度的研究，已有高敏、张旭华二先生的《南朝典签制度考略》（上、下）一文，论述颇精，于此从略。
（四）录事参军
东晋南朝时期，在军府佐吏中还有录事参军一职，也经常兼带州行政职务。如《梁书》卷11《张弘策传》载：“（建武）五年秋〔永泰元年〕明帝崩，遗诏以高祖（萧衍）为雍州刺史，乃表弘策为录事参军，带襄阳令。”同卷《庾域传》载：“（庾域）长沙宣武王为梁州，以为录事参军，带华阳太守。”此外，还有其他没有标明是军府中哪个部门的参军的，也经常带郡丞或太守。可见，东晋南朝时期，军府佐吏兼带地方行政职务成为一种常态。其余的如檀凭之，“转桓修长流参军，领东莞太守……”则不胜枚举。
五州行政佐吏
南朝时期州行政佐吏系统中，别驾和治中仍然是刺史之下最为重要的属佐之一，并在州行政机构中发挥重要作用。
（一）别驾
南朝时期的别驾仍为州之上纲，人选极为慎重，通常为士族所占据。《御览》卷263《庾亮集答郭逊书》云：“别驾。旧典，与刺史别乘周流宣化于万里者，其任具刺史之半，安可任非其人。”易雄，“举孝廉，为州主簿，迁别驾。自以门寒，不宜久处上纲，谢职还家”。《梁书》卷9《柳庆远传》：“高祖之临雍州……求州纲……因辟别驾从事史。”都说明这一点。
在职掌上，《宋书》卷40《百官志下》载：“别驾、西曹主吏及选举事……”这一职掌史书中确有反映。如《梁书》卷10《邓元起传》载：“初，元起在荆州，刺史随王板元起为从事，别驾庾荜坚执不可，元起恨之。”所以，州吏的辟除，孝秀的选贡，别驾都要参与其事。但这只是制度内的规定，南朝时期别驾的职事远在主吏及选举之外。能够见到的还有如下情况。
1．代刺史总一州之任。南朝别驾，间或亦像州长史、司马一样，总一州之任。如东晋襄阳人习凿齿为桓温别驾，“温出征伐，凿齿或从或守，所在任职，每处机要”。宋张茂度，“还为扬州别驾从事史。高祖北伐关洛，复任留州事”。蔡廓，“及高祖领兖州，廓为别驾从事史，委以州任”。南齐张岱，“新安王子鸾以盛宠为南徐州……高选佐史，孝武帝召岱谓之曰：‘……今欲用卿为子鸾别驾，总刺史之任……’”
