随着光绪帝的驾崩，一个时代随即落幕。让光绪帝一生饱受摧残的罪魁祸首慈禧太后，在光绪帝驾崩后不到24小时，也驾鹤西去了。11月12日时，慈禧太后全身就已经严重的麻痹，甚至连脸上的肌肉都难以控制。太医们一直奋力救治她，但她心里已清楚，自己的最后一刻很快就要到来了，在光绪帝驾崩的时候，慈禧太后的情况已经十分危急。但是随着14日晚一道另立新君的诏书的发布，对于慈禧太后的身体状况，人们又重新燃起了希望。但第二天早上，病痛又卷土重来，慈禧太后身体状况急转直下。从她给新君的一份诏书中可看出慈禧在弥留之际的心境。这份诏书具体内容如下：
“此时，我已病入膏肓，我知道我将不久于人世。从此以后，朝中所有事物交由摄政王处理。当遇到重大问题之时，摄政王应与新任皇太后裕隆商议。”
在发出这份诏书后，慈禧太后很快便不省人事，15日下午3点，慈禧太后驾崩，她所留下的还有一份给所有大清子民的告别信：
“我此生最大荣耀就是在咸丰帝驾崩后收到立载淳为君的诏书。我的儿子同治帝载淳在举国叛乱不断之时，登上了帝位。那时，太平天国起义、捻军叛乱、贵州叛乱轮番来袭，严重扰乱了大清的秩序。沿海各省陷于慌乱之中，而当地人民也被巨大的困难和穷苦包围。与东宫太后慈安一道，我们扛起了朝廷的重担，为朝事日夜操劳。遵照咸丰帝生前指示，在我俩与各地官员和军队的通力协作下，努力确保了这些地区的和平。在朝中，我举贤纳才，悉心倾听他们的意见和建议。我平复了饱受洪水和饥荒危害的大清子民的痛苦。在老天的眷顾之下，叛乱终于平息，大清又回归了和平。
同治帝驾崩之后，光绪帝继承其位，但在这时国家形势仍然严峻，人民饱受苦难折磨。在内忧外患不断，灾难从未停息的情况之下，理应由我承担起改革的重担。在我发布立宪诏书的前一年，我就已经说过这一天一定会到来。
幸运的是，我一直身体安康，精力充沛。但不曾想到，自从今年夏天以来，我时常感觉不适。然而，国事繁忙，我无法停下来休息。渐渐地，我开始失眠，胃口也不太好，直到我身体彻底垮掉的那天，我从未休息过一日。
在光绪帝病危的这段日子里，我更是悲伤不已。我再也无法振作起来，而这时我的身体状况也十分糟糕了，恢复原状的希望也已全部破灭。
现在，国家正处在缓慢地变革之中，而新君仍然年幼，还需要指导与帮助。摄政王和大臣们必须协助新君，以稳固大清根基。
新君必须忘掉悲伤，孜孜以求，让大清传统发扬光大。这也是我迫切希望的。对我的哀悼有27日便足矣。请将这份诏书公之于天下，让所有大清子民知晓！”
但是慈禧太后所希望的27日的哀悼日最终并没实现。当然，她也不希望此事的发生。在她驾崩之日，朝廷以小溥仪的名义发布了一道诏书，这也十分值得我们关注：
“在朕幼儿时期，得到了伟大的慈禧太后的无尽关爱和照顾。朕对其无比感恩。朕多么希望和蔼可亲的慈禧太后能够身强体壮，万寿无疆，这样朕便可以得到她悉心的指点和帮助，在她的坐镇之下，大清才会更加强盛。但是繁重的国事，最终还是压垮了她的身体。太医们纷纷为她诊治，希望她能早日好起来。然而，事与愿违，慈禧太后最终龙御归天。朕悲伤至极。在慈禧太后最后的遗嘱中，慈禧太后希望哀悼的时间只限27日。朕认为这并不足够。为充分表达对慈禧太后的哀悼之情，戴孝时间应为100日，而治丧期为27月。当然，在悲伤的同时，朕也会控制自己的情绪，以国事为重，这也是慈禧太后临终前交待的。朕将尽量调整好情绪，以慰慈禧太后在天之灵。”
结合光绪帝和慈禧太后去世的时间，我们可以推断出，这份诏书虽然是以溥仪名义发布的，但实际上应出自他们之手。我们必须注意的是，在慈禧太后最后发布的诏书中，对光绪帝之死表示异常悲伤，但有人仍认为，官方所公布二者死亡时间有误，慈禧太后应在光绪帝之前驾崩。
关于慈禧太后和光绪帝之死，坊间传闻也没有过于离奇之处。而关于光绪帝之死传闻却说得很是详尽。据说，一位参与光绪帝病情诊治的郎中在光绪帝生病后期收受了袁世凯给予的33，000美元。赫兰教授似乎对此深信不疑，他认为光绪帝是被毒死的，而且死于慈禧太后之后，而后来发布的诏书是为了起到掩人耳目，掩盖真相的目的。为了让传闻更具可信度，人们把这描绘成一次宫廷阴谋，不仅袁世凯受到牵连，连醇亲王和几个官员也牵涉其中。
1898年，袁世凯背叛光绪帝。但是在袁世凯背叛光绪帝十年的时候，实在没有必要再以谋杀皇上之名而玷污他的名声（此为作者本人观点）。大多数人宁愿把光绪帝和慈禧太后之死归结为自然因素，认为二十四小时内生前针锋相对的两人的相继离开不过是一次巧合。
仅仅在慈禧太后去世几天之后，庆亲王也随两位皇室宗亲离开人世。关于庆亲王，还有一个不可思议的传闻，据说，庆亲王所在支系为皇室支系中较远一支，他其实不够格世袭亲王之位。关于庆亲王的死，民间也有多种说法。有人说，光绪帝和慈禧太后驾崩之后，庆亲王因为过度悲伤而亡；还有人说庆亲王是由于不被允许参加12月2日新君的登基大典不堪屈辱而亡。在他72岁的时候以这样的结局离世，让人倍感震惊。但是庆亲王之死在宫中并没掀起多大波澜。相反的是，对于在华的外国人而言，他的去世这无疑是一个巨大的噩耗。庆亲王在外国人中颇有名望，尤其是自从1901年的谈判之后，他与西方外交家开始定期地接触。
光绪帝的遗体在宫中停留一百天后，在第1909年春天被暂时安置在距京城八十英里的皇家陵园东陵。
光绪帝一直以来都没有为自己的陵墓选址，因此，在他死后，陵墓的选址和建造都迫在眉睫。慈禧太后在多年以前就已经开始为自己建造陵墓了。慈禧陵墓的建造主要由慈禧太后亲信兵部尚书荣禄负责，地址选在东陵咸丰的陵墓附近，陵墓的修建花费超过一百万英镑。生前慈禧常常来此巡视，看看陵墓情况是否良好，陵内建筑是否足够奢华。在慈禧太后去世约一年后，她的遗体被从紫禁城运往东陵，她生前最笃信的礼部为其选好了吉时，即：1909年11月9日早上5点钟。
在真正的葬礼举行之前，宫中为慈禧太后举办了一次悼念活动，很多外国人也饶有兴趣地参加了。在8月30日的时候，慈禧太后的遗体仍然在宫中，礼部选择了一个吉日，在紫禁城城墙旁的空地里，正对着慈禧太后棺材所放之处焚烧了一艘一百八十英尺长的丧葬船。这艘船做得惟妙惟肖，各种物品应有尽有，在船桨旁边，还有与真人一样大小的船夫，船中还有真人大小的宫女和太监等，他们都穿着丝质长袍。丧葬船四周甚至还有水围绕，水中还有莲花开放。这艘船造价大约7000英镑，它能够让慈禧太后在另一个世界中也能够在湖中畅游，就如她生前喜欢在颐和园畅游一样。
除此之外，还有三千个真人大小的纸人，其中包括：骑兵、步兵、乐师、官员、马匹、马车、轿夫等。按照中国人的说法，将这些人烧给慈禧太后后，她便可以继续得到他们的服侍。
11月9日早晨5点之前，慈禧太后的棺材上已经盖上绣着龙的金黄色锦缎柩布，随后八十四位轿夫抬着她巨大的灵柩缓缓走出宫中，庄严地向内宫东北大门走去。
灵柩所经之处都洒满了黄沙，道路两旁站着维护秩序的士兵和警卫。送葬队伍在醇亲王、宫中众亲王以及军机处和内阁所有大臣的带领下行进着。外国公使团按长幼顺序排列，慢慢走在灵柩前头，以表对慈禧太后的尊敬。在灵柩后面的是穿着现代军服的骑兵，而骑兵后面是与其对比鲜明的牵着骆驼的蒙古侍从，在骆驼身上驮着在队伍休憩之时用于遮挡慈禧太后灵柩的棚子。接着，是一排排举着葬旗的仆役。仆役之后，是身穿深黄色袈裟的喇嘛和尚，还有一队扛着满族祭祀船只、佛教象徵、鲜艳旌旗的人。除此之外，还有三辆大车，满载绣着龙凤的黄色丝质服饰和帘子以及慈禧太后生前最喜欢的两个轿子的四轮马车。
出城之后，慈禧太后的灵柩换由一百二十位轿夫抬着。而摄政王在城门与外国使团告别后，将他们安排到一个专门为他们而建的楼阁里。摄政王带领丧葬队伍走到城外一段距离之后，便回到宫中，而丧葬队伍则继续东行。
然而光绪帝的葬礼就没有如此奢华壮丽了。光绪帝葬礼花费不到五十万两，而慈禧太后的花费在一百至一百五十万两之间。《泰晤士报》记者评论道：“在中国，葬礼的花费多少代表着逝者地位的尊贵与否，也与他的‘面子’密切相关。我们对比光绪与慈禧葬礼的数据之后，便会发现一些有趣的现象。”
