云居寺始建于隋朝（时曰智泉寺），不过，隋时房山属涿县，离北京（时称幽州城）约70多公里，今天已划入北京西南郊房山区。
在云居寺周围两平方公里的范围内，内云居寺，石经山藏经洞，唐、辽塔群构成了我国古代佛教文化一大宝库。
云居寺有五大院落六进殿宇，东接上方山，西俯柜马河，占地7万多平方米，两侧有配殿和帝王行宫、僧房，并有南北两塔对峙，历史悠久，饱经沧桑。解放后，云居寺经过两次大规模修复后重现庄严。云居寺古时亦有“碑海塔林”之称，现存碑20余块、塔10余座，是其宝贵的文化遗产。
石经山在云居寺东二里处，俗称小西天，海拔450米。这里不仅是房山石经刊刻起源之处，也是佛祖舍利出土之处，4196块隋唐石经为国之重宝，以雷音洞、金仙公主塔为代表的众多历史遗迹，具有极高的价值。
据考，石经始刻于隋大业十二年（605年），僧人静琬为维护正法，镌刻经于石。刻经事业历经隋、唐、辽、金、元、明六个朝代，绵延1039年，刻佛经1122部，3572卷，14278块，分藏于石经山9个藏经洞和云居寺地穴之中，规模之大，历时之长，是世界文化史上罕见的壮举，堪与闻名寰宇的万里长城、京杭大运河相媲美，是世上稀有而珍贵的文化遗产。现又将木雕《龙藏经》77万多块，明代经2万多卷运藏于寺。石经、纸经、木板经这三种经本被称为世界“三绝”。
北京的寺庙众多，名刹宝刹灿若群星，但是，北京并未因此而号称“佛都”。事实上，北京的许多大庙都可以在中国历史上留下浓重的一笔。比如云居寺，这个拥有如此厚重文化底蕴的寺庙被世人誉为“北京的敦煌”，绝非过誉。
