处理好东中西部的关系。总的来说，东部地区经济发展水平较高，适宜发展资金、技术密集型的现代农业；中西部地区劳动力丰富、资源优势明显，适宜发展劳动密集型、资源密集型的产业。
处理好现代农业与现代农民的关系。发展现代农业，一方面要靠国家政策提高农民发展农业的积极性，另一方面需要通过培训提升农民的发展能力。当前发展现代农业的重要任务是培训"有文化、懂技术、会经营"的新型农民。
处理好发展现代农业与农民增收的关系。农民增收与农业发展，并不一定是同步的。有的地方农民增收了，农业却萎缩了。非农收入比重越来越大。只有发展现代农业，才能使农民通过农业产业本身增加收入，稳定农业生产，促进农业发展，才能对国民经济高速发展起到支撑作用。
处理好外部支持和挖掘农村内部潜力的关系。在基础设施投入和公共服务建设上，国家是投入的主体。在这方面，必须贯彻"工业反哺农业，城市支持农村"的方针，主要依靠国家和地方财政扶持，以及社会力量的广泛参与。在产业发展上，政府应对资源配置、建设规划、制定政策等起着主导作用。建设现代农业的主体是农民，任何外部的力量，归根到底都是通过农业自身的吸收能力和转化能力，使输血变成造血，形成发展农村经济的资本。即通过挖掘农村内部潜力，调动广大农民积极性，把政府财政援助和补贴集中用在发展农业生产力上，把重点放在发展本地的支柱产业与特色产品上。
