同日中共中央致陈毅、张云逸、黎玉、张鼎丞、邓子恢、粟裕、谭震林并转各区党委、各师各纵首长电，指示：“鼓励一切正规军、地方军及民兵发挥积极性，多打胜仗，各个击破与大量歼灭敌人。要告诉山东及华中全党全军，必须大量歼灭王耀武（十四个旅）、薛岳（三十五个旅）、汤恩伯（十五个旅）三部之正规军，方能解决问题。胶济我军及鲁南、苏北我军对王耀武薛岳两部应各以歼灭三分之一（即五个旅与十二个旅）为第一步目标。苏中我军已于过去一个半月中（午元至未感）歼敌正规军六个半旅、交通警察五千，已接近歼敌二分之一，今后应以歼敌十分之八至十分之九为目标。歼敌方法，是集中大力打敌一部，例如：苏北午感渔沟战役集中十二个团（实际使用七个团）歼敌九十二旅两个团，苏中未宥如皋西南战役集中十个团歼敌九十九旅两个团就是好例。这种打法，通全局看来，用力省而成功多，每战必胜，既能全歼，又能速决，必须教育干部普遍采用。”
同日中共中央军委致陈毅电，指示：“你率主力应在睢宁以东地区待机。
仿粟裕办法，集中主力歼敌一部，休整若干天又打，打后又休整若干天。如此常保高度士气，纪律亦可改善。九月正是作战时机，刘邓军、中原军均希望你军配合。此时不打，敌占地愈多，威风愈大，我士气民气均将受损，故必须寻机作战，灭敌人威风，壮自己志气。”
8月31日华中野战军第五旅攻克黄桥，国民党军第一○六旅5个连缴械投降，如黄路战斗胜利结束，总计歼敌17万人。
同日与谭震林联名发出致中共中央军委并陈毅、宋时轮、张鼎丞、邓子恢电，报告苏中参战部队现状和今后作战方针，提出：“我们现正包围海安，加强政治攻势迫广东军（共五个营及师旅两个直属队）起义，否则拟于军事准备充分而有把握时攻占之。但在此期间，如敌二十一师（两个旅已到南通）及二十五师（一个旅已到泰州、口岸线）来援，则决舍海安而歼灭其援敌。海安得手后，部队必须休整二十天至一个月，再行相机攻占泰州、仙女庙之线。但必须予二十五师以歼灭打击，经扫除扬泰线以巩固邵伯外围，而后转移主力于淮南，恢复三分区，并设法截断蚌埠路，以配合淮北之作战。”中共中央军委9月2日复电指示：“世午电悉，甚慰。各事照你们计划办理”。“准备在主力他调后仍有得力部队留苏中作战，保卫苏中不失”。
同日下午，在华中野战军排以上干部会议上作题为《四十五天自卫战简述》的报告，着重从战略指导上总结苏中战役的经验，指出：所以能取得这样大的胜利，“在政治上来说，我们是自卫，是为了消除内战、保卫和平民主独立而战，是正义战争，得到解放区人民全力的支持，得到全国乃至全世界爱好和平的民主人士、广大人民的同情拥护，特别是有党中央与上级的正确指导”。在军事上，“首先是由于我们没有机械地教条主义地运用战略指导原则”。“除了上述政治军事原因之外，主要是消灭了敌人的有生力量。因此，大家要记住：谁保存了有生力量，谁就会胜利；谁消耗或者丧失了有生力量，谁就会失败”。
9月1日新华社驻华中记者发表评论《苏中南线战局纵横谈》，指出苏中战役有四个特点：第一，大兵团运动战。第二，地方民兵与主力军机动之配合。
第三，蒋军指挥官，初则轻视新四军，后则慌乱不堪。第四，蒋军士气低落和内部矛盾。这篇评论发表在1946年9月2日的延安《解放日报》上。
9月2日与谭震林联名发出致中共中央、陈毅、宋时轮并张鼎丞、邓子恢电，报告下一步作战计划：“苏中战场第一期作战在九月份完成后即可西进，顽如援兵不来，可以提前十五天西进。”中共中央军委9月4日复电指示：“计划甚好。希望能于九月上半月完成东面作战任务，下半月休整。十月上旬攻取扬泰线，中旬休整，下旬进入淮南作战。”
9月3日中共中央军委致粟裕、谭震林并告陈毅、张鼎丞、邓子恢、刘伯承、邓小平电，指示：对自觉起义与被迫起义的国民党军队应区别对待。
9月4日淮北地区国民党军积极部署进攻淮阴，同时以一部向东佯动，整编第七十四师与整编第六十九师进至宿迁、睢宁一线，第七军两个师进至泗阳以北的洋河、凌河一带。
同日陈毅、宋时轮致中共中央军委并告张云逸、黎玉、张鼎丞、邓子恢电，提出山东野战军行动的三个方案（北移沭阳，出击洋河，现地待机），而倾向第一方案，即北移沭阳，迎击自宿迁东进之整编第七十四师、整编第六十九师。
9月5日邓子恢致陈毅、宋时轮并报中共中央电，认为山东野战军行动方案以留现地待机为上策。
同日发出致张鼎丞、邓子恢电，认为：“敌占宿迁、洋河之线，有进犯两淮之极大可能，来直捣我华中心脏与截断华中与山东之联系”，“以山野目前之布置，似乎让敌过黄河以东再与敌决战。如决战顺利两淮当无问题，否则华中局势将受极大影响”。“不知军长整个作战步骤与决心如何”，华中野战军须视山东野战军行动决定下一步作战方向：如山野不打进犯两淮之敌，则华野主力西进截断扬泰线；如山野于泗阳歼敌，华野主力则在攻占海安后南攻如皋。9月6日，邓子恢将此电转报陈毅并中共中央，并说已将陈毅、宋时轮4日所提三个方案转告粟裕。
9月6日邓子恢、张鼎丞发出致陈毅、宋时轮、张云逸、黎玉、中共中央、粟裕、谭震林电，认为蒋军南北夹击两淮，势必影响整个华中、苏中前线及未来战场，陈、宋所提三个方案，只能采取第三方案，并请陈毅、宋时轮考虑调叶飞纵队南下，或调粟、谭主力北上，集中力量解决蒋军主力。
同日中共中央致陈毅并告张云逸、黎玉、张鼎丞、邓子恢电：“请你考虑调第八师即回鲁南，暂时受叶飞指挥，协同一纵及两个地方旅组成鲁南前线，我们准备派徐向前来鲁负鲁南前线指挥之责。你率二、七师及九纵组成淮海前线，准备敌截断陇海时，亦有一个时期留在淮海区域。如此则胶济、鲁南、淮海、苏中四个前线均有适当兵力与指挥人员，而你则负统筹各个前线之责，并直接指挥淮海。这样是否妥当，或有其他方案，望考虑见复。”
同日华中野战军第一师开始总攻海安。
9月7日辰时，与谭震林联名发出致陈毅、宋时轮并中共中央军委、张鼎丞、邓子恢电：“我们请求山野必须在淮泗地区打几个仗，以挫敌锐。否则，两淮不保。如两淮失掉，不仅政治影响不佳，且直接影响南线作战甚大”。“如山野必须离开淮泗而向北转移攻势，则请求将二纵（四、九旅）留下。我们当于攻占海安后，暂时放弃苏中之较有利局面，而转移主力于淮泗”。
同日陈毅到淮安华中分局，与张鼎丞、邓子恢商谈淮北战局和作战部署，并于当天向中共中央报告会商结果，“认为集中兵力在淮北大有开展的机会”，“全国战局均需要在淮北打几个胜仗”。目前秋高水落，敌情及气候、地利均发生有利于我的变化，“经与张邓共同考虑，九、十两月在淮北集中兵力正好作战，可望改变战局”。因此建议第八师暂不北调，并表示“欢迎向前来鲁”。
同日晋冀鲁豫野战军定陶战役胜利结束，歼敌4个旅17万人。延安《解放日报》于9月12日发表题为《蒋军必败》的社论，指出：这一胜利“是继续中原我军突围与苏中大捷之后又一次伟大胜利。这三个胜利，对于整个解放区的南方战线，起了扭转局面的重要作用”。
9月8日中共中央军委致陈毅、张鼎丞、邓子恢并告张云逸、黎玉电，指示：“我刘邓军已大胜，对你们必有帮助。同意八师暂不北调，俟秋高水落，集中兵力在淮海歼敌，并与粟、谭南北配合，巩固两淮，开展局面。”
同日与谭震林联名发出致陈毅、宋时轮并中共中央、张鼎丞、邓子恢电：
“我们认为军长将主力转至沭（阳）宿（迁）间阻顽东进之方案，在实质上，将使敌人迅速占领两淮及运河线，变成放弃华中而使山野主力被迫撤回山东。如此，苏中主力势必造成我军因无后方补给，在强敌三面包围下无法北撤，只有渡江南进。如军长仍坚欲北开，则我们坚决要求调二纵全部留下，由韦国清统一指挥，钳制敌人。候苏中主力北转，以求阻击南下之敌，否则华中战局变化，责任难负。”
同日未时，与谭震林联名发出致中共中央并陈毅、宋时轮、张鼎丞、邓子恢电，报告华中战场态势，判断国民党军将集中兵力南北夹击邵伯、高邮和淮安、淮阴。“如两淮一失，高邵不保，整个运河线丧失。顽从两淮窥盐阜，从高宝进窥兴化，将我苏中主力迫至东台一蠡之地，此为华中最坏前途。因此，我苏中主力决心放弃围攻海安，求得十天左右之休整，逐渐转回泗阳地区，求得给桂顽以打击，稳定华中局势”。中共中央军委于9月9日复电指示：“同意放弃［攻取］海安，休整十天，准备向北机动。”
9月9日子时，陈毅、宋时轮致张云逸、黎玉、粟裕、谭震林、张鼎丞、邓子恢并中共中央电，认为淮北敌情正在变化中，决定再看数日，然后或歼东进之敌，或西攻睢宁、宿迁地区，“保证可以改变战局”。指示：“粟谭部队仍以打下海安，争取休整，相机转移为最好。”中共中央军委9月10日复陈毅、宋时轮并告张鼎丞、邓子恢、粟裕、谭震林电，指出：陈毅所率主力在确有歼敌良机时出击，“借以改变战局，甚好甚慰”。指示：“粟谭军连战疲劳，亟待休整”，“无论将来向何方作战，似以放弃海安即时休整”为宜。同日又电陈毅并告粟裕、谭震林，指出：“陈电决定待宿迁蒋军渡运东进，我军准备于宿迁、新安、沭阳之间歼敌，或进至睢泗地区歼敌，以打中央系为目标，不打桂系，此项计划甚好。”
“惟现时桂系集中四个团于洋河，距两淮甚近，我们在泗阳方面之防御力量如何？
如洋河之敌向泗阳前进，你们如何对付？”
同日未时，与谭震林发出致陈毅、宋时轮并中共中央、张鼎丞、邓子恢电，提出：由于“刘邓军大捷，军长率部亦准备出击，淮北战局开始好转，两淮危险大减。因此我们仍决定继续攻占海安，以争取苏中万余人之参军补充”。海安得手后，休整一短时期，“再北移或西攻”。中共中央军委9月10日复电指示：
“如你们认为攻占海安于大局有利，则可决心攻取海安。”
9月10日陈毅、宋时轮联名发出致中共中央军委并华中、山东、华野电：
“与各师会商，均不主张在泗阳作固守防御，故采取由北向西的作战方针”，“准备绕道攻占古邳、双沟、睢宁等地”，并说“已部署部队北移六塘河北”，“留九纵守备泗阳”。“执行此办法，泗阳可能失守，估计敌未到淮阴之前，我军西攻奏效，则淮北局势改观，两淮仍能保持”。
同日张鼎丞、邓子恢致山野电：“请军长在淮北敌行动未明以前，山野仍集中原地不动，确保众兴、陈道口一线，以保两淮安全。否则，九纵很难挡住桂顽进攻”。同时表示：“我们同意粟谭主力北调，但目前仍须攻占海安，以免功亏一篑。”
同日辰时，与谭震林发出致中共中央军委并陈毅、宋时轮、张鼎丞、邓子恢电，报告决定继续攻占海安，并报告谭震林将于11日返淮安，“拟赴军长处报告近况”。
同日粟裕发出致中共中央、陈毅、宋时轮并张鼎丞、邓子恢、谭震林电，报告华中国民党军动向：汤恩伯将接替李默庵负责华中南线指挥，准备于10月初发动第二期进攻。“估计其第二期进攻兵力，可能比第一期为多，惟进攻手段或可能会比第一期更疯狂、毒辣、谨慎”。“我即或攻占海安，而今后仍有失陷之极大可能”。“依作战指导来说，恐在第二期作战中尚须引诱敌人更深入一些（或在必要时再放弃一些地方），才便于歼灭敌人与粉碎其第二期进攻。因此，与其现在占海安，则不如以攻占海安之伤亡，留作第二期作战消耗，对整个战局之长远打算更为有利”。建议放弃攻占海安的计划，第五旅北援淮北，第一、第六两师集结于苏中整补待机。
同日国民党军整编第七十四师、整编第二十八师、第七军南下，其第一七一师进攻华中野战军第九纵队泗阳阵地，在众兴一带展开激战。
9月11日1时，中共中央军委致粟裕、谭震林并告陈毅电，通报华中蒋军将于10月发动新进攻，企图在11月攻占两淮。对于华中野战军主力行动方向，提出两个可供选择的方案：“你们必须于数日内夺取海安，以便休整十天，于九月下旬采取新行动，事前破坏汤恩伯计划；或放弃海安，进攻扬泰线，得手后休整待机。究以何者为宜，望按实情处理。”
同日午时，发出致张鼎丞、邓子恢、谭震林并陈毅、宋时轮、黎玉、中共中央军委电，报告已令第五旅北上，拟放弃攻占海安，第一、第六两师集结休整，建议叶飞、赖传珠纵队南下。
同日谭震林致中共中央、陈毅、宋时轮及粟裕电，说他于今日晨赶到淮安，“华中野战军主力最快要二十号才能赶到两淮”。现淮北局势紧迫，望五旅赶回两淮，叶飞、赖传珠纵队急抽两旅参战。
同日陈毅于午时（11~13时）、酉时（17~19时）连发两电给中共中央军委并张鼎丞、邓子恢、粟裕、谭震林，称与张鼎丞、邓子恢商谈，“山野决心在泗阳、淮阴间歼敌，以保卫两淮，以改变战局。部队明晚即可部署就绪。分批歼敌两旅到三旅是有把握的”。9月12日，中共中央军委连发两电给陈毅、宋时轮并告粟裕、谭震林，指出陈毅9月11日电“部署甚好”，指示：“你们务必在泗阳、淮阴之间歼敌一个至两个旅，顿挫敌锋，以待粟谭主力到达，歼灭余敌。
此战关系大局，望集中全力以赴。”又电指示：“你们此次歼击南下之敌，务期必胜，首先只打一个旅，以期速决尽歼，得手后再打一个旅，决不可同时打两个旅。”
同日中共中央军委致陈毅、张鼎丞、邓子恢、粟裕、谭震林电，指示：
“粟谭率主力即开两淮机动位置，到达后如北面南下之敌已歼灭，则在两淮休整待机，或配合二、七、八师全力打开淮海局面，或向南攻取扬泰线，或向淮南路东歼敌。”
同日亥时，发出致陈毅、宋时轮并中共中央、张鼎丞、邓子恢电：“建议山野主力依靠泗阳正面阻击或以翼侧向敌作反突击，歼敌一部，以挫敌锐。待第一、第六两师到齐后，两个野战军配合击敌，效果较大。如山野单独挺入敌后，恐难于短期转变战局，亦不易调转向两淮进攻之敌。”
同日亥时，中共中央军委致陈毅、宋时轮、张鼎丞、邓子恢、粟裕、谭震林电，指示：“敌六个旅南下，两淮危急，粟率苏中主力（一、六师）立即开两淮，准备配合陈宋主力彻底歼灭该敌。但陈、宋现应独立作战，务于粟、谭到达前歼灭南下之敌一个至两个旅，顿挫敌之前进，争取时间，以待苏中主力到达，协力歼敌全部。”
9月12日率领华中野战军主力北上，于9月13日夜间到达东台县城以南的富安，在那里发电报给陈毅和张鼎丞、邓子恢、谭震林，报告：“五旅一部昨晚已由东台北来，其余正续进中。一、六师北来参战当不成问题，祈放心。虽然他们对苏中有些恋恋不舍，但会绝对服从整个战争利益的。”当夜即乘汽车北上，于9月14日下午到达淮阴城东之马厂王高村华中军区驻地。
