小智等人继续旅行。期间经过一个叫做黑暗镇的地方，这个地方地方萧条，因为黑暗镇有两所道馆，一所是卡兹道馆，另一所是亚奇道馆，两所道馆为了争夺联盟道馆的称号而展开了对抗，弄得黑暗镇民生萧条。最后在联盟派下来的乔伊小姐的调节下，两个道馆之间的战争也解决了。
离开黑暗镇后，小智等人继续向下一个地方前进，路上，小智也经过了好几个城市，这天，小智来到了一个小镇，小镇中看到许多人看扛着铁楸和锄头进进出出，小智突然想到，自己已经来到了大傻谷了。
“啊，这些人是干什么的，大傻谷到底发生什么事情了”，看到好多人拿着镐头等东西一起向前走去，小霞非常的好奇。
“挖化石吧，这个地方发现了已经绝种的神奇宝贝的化石，可能就是这个原因吧”，小智当然知道原因，解释说。
因为有人前不久在大傻谷挖出了古代精灵的化石，消息传了出来之后，所以就吸引了不少人过来。不过小智知道，真正的古代精灵可是在地底下的，化石还得需要化石复活机复活。
“小智。”小智听到后面有人在喊自己的名字，转身过来一看，原来是小茂。
这次小茂穿着旅行用的长裤和高筒靴，头顶上带着一定帽子，肩膀上正扛着一个铁楸，在他的身后，自然是少不了的美女支援团。
“你也是来挖化石的吗？”小茂问道。
“算是吧！”小智淡淡的说道。
“这回我们比比看看谁先挖到化石。”小茂信心满满地对小智说道！
“随便你………”小智无语的说道！
随后小智看着小茂拿着鹤嘴锄来到一处地方对地面狠狠敲了下去，很快的现了一枚螺旋体化石。
“成功了，我得到远古小精灵化石了！”小茂拿起化石兴奋说道。
“小茂加油，小茂加油，小茂小茂一级棒！”小茂身后美女啦啦队兴奋叫道。
这时，一个博士接过小茂手里的化石，拿着放大镜仔细的看着。
“啊哈哈，怎么样，我一挖就挖到了，对了，你知道这是什么小精灵的化石吗？”小茂自豪的说道。
“嗯~~这个是……”博士拿着化石说道。
“这个是……”小茂紧张说道。
“这个是小精灵的大便化石！”博士坦然说道。
“砰！”小茂雷倒了。
“讨厌，大便！！”美女啦啦队尖叫道。
“呵呵……”小智见此有些被小茂搞笑了。
“哈哈哈！…他是猴子请来的逗逼吗？”小霞大笑道。
“呃…”听着小霞的话，小智有些无语，这句话应该是在地球那里说的吧！
“没想到来了这么多人啊！”小雪看着密密麻麻的人们感叹说道。
小智对小霞和小雪说去挖化石，考虑到待会有些危险，小智便找了个理由与小霞小雪分开了，然后往山谷底部走去。
走了很久，确定了自己所在的地点就是山谷的最低处以后，找到了一块偏僻的空地，这块空地是食野的死角，而且非常少人经过。
小智的目标是化石翼龙，所以他可不想自己在和化石翼龙打架的时候被人打扰。大傻谷是小智在意的一个地方，因为这里有古代的化石翼龙精灵，要知道，古代的精灵都是非常的强悍，而化石翼龙更是处于精灵金字塔顶端的精灵，在那个时候，只有适者生存！
再说他也想知道古代的神奇宝贝与现在的神奇宝贝有什么不同？所以小智对于化石翼龙充满了兴趣。
“干活了。”小智对着肩上的皮卡丘说道，“你在这里挖洞下去看看下面是不是空的。”
“皮卡~皮卡~”皮卡丘叫了一声从小智的肩膀上跳了下来，活动了一下身子，然后对着地面开始挖洞，不一会儿就走了上来，然后朝着小智点了点头，小智见此从洞中跳了下去！
小智从皮卡丘挖的洞中下去到了地底。地底非常的宽敞，足足有几个篮球场的大小，有点大而且错综复杂，不一会儿小智轻易的发现了古代精灵们沉睡的地方，有两个地方地方，一个地方是化石盔和菊石兽沉睡的，另一个地方是化石翼龙沉睡的。因为化石翼龙是处于食物链的顶端的，化石盔和菊石兽不敢和化石翼龙睡在一起，只能找其他的地方一起沉睡。
小智先来到化石盔和菊石兽沉睡的地方，总共有几只化石盔和几只菊石兽。化石盔和菊石兽的实力都是比较弱的，但是因为背上有壳，所以大多数的精灵都不把它们当目标，所以化石盔和菊石兽才能安全的存货到至今。
小智让皮卡丘去，顿时皮卡丘跳下地面大叫了一声，皮卡丘声音的有点大直接把化石盔和菊石兽惊醒了，看见皮卡丘，几只只化石盔和菊石兽对着皮卡丘大吼了一声，想要攻击皮卡丘毕竟被人打扰睡觉是谁的心情都不是很好！
不过几只化石盔和菊石兽直接被皮卡丘一记10万伏特全都放倒在地，小智全都收进去了精灵球里面，将两只化石盔和菊石兽传了回去。留下两只化石盔和菊石兽！
小智相信大木博士会喜欢的他们的吧！而留下的两只小智想送给小霞，毕竟这么久了他还没有送过什么东西给小霞呢！
就在这时，洞的深处传来了一阵巨吼，吼声仿佛是来自远古的咆哮，小智知道，正主要出现了。
果然，张着巨大的血盘大口，挥动着坚硬而有力的双翅，拖动这强而有力的尾巴，全身像岩石一样坚硬的精灵向小智袭来，果然是小智看上的化石翼龙。
“皮卡~”就在这时，皮卡丘跑到小智面前一把抓住了化石翼龙的尾巴，然后拉着化石翼龙旋转了几圈，将其扔出去。
“砰！”顿时一些石柱被化石翼龙给撞碎，不过这并没有给化石翼龙带来多大的伤害。反而激起了他的斗志。
“吼！”从石堆里爬出来化石翼龙向着皮卡丘咆哮起来，口中积蓄着能量，好快的速度，瞬间一发破坏死光就朝皮卡丘喷去。
不过皮卡丘也也不是这么简单，瞬间的反应过来轻易的躲开了破坏死光。因为皮卡丘小智还有化石翼龙是在一条线上。所以在皮卡丘躲开破坏死光，而破坏死光继续向的小智射来！
看着喷射而来的破坏死光小智淡淡一笑。握紧拳头一拳击去，顿时破坏死光被打飞出去。
“吼！”见此场景化石翼龙大吃一惊。就连什么时候皮卡丘已在身边的他都知道！“皮卡~”皮卡丘的尾巴发着白光，一记铁尾狠狠的打在化石翼龙的腹部！
化石翼龙再次被打在石墙上！不过并没有失去战斗能力，而是吃痛的摸着腹部！
“不错嘛，要是现在的神奇宝贝吃了皮卡丘这一记铁尾肯定已经失去战斗能力了，看来古代的神奇宝贝的确很强！”看着没有失去战斗能力的化石翼龙小智暗暗道！
“吼！”化石翼龙大叫了一声牙齿发着寒光，冰之牙直接咬向皮卡丘，不过皮卡丘使出电光一闪躲开了化石翼龙的冰之牙！打开了化石翼龙的冰之牙，皮卡丘全身发着电光，10万伏特打在化石翼龙的身上！
“吼！”化石翼龙吃痛的大叫了一声，便不甘倒在地上！小智见此扔出一个神奇宝贝球顿时化石翼龙便被收服了！
收服化石翼龙后，小智又在洞里寻找了半天终于找到了那颗蛋！将那颗蛋小心翼翼的放入背包里后，便和皮卡丘从洞里爬了出去！
到了地面，小智和皮卡丘将洞口埋了起来！不过此时已经是下午了！
小智回到了小雪和小霞那里。小雪和小霞早就有些不耐烦了，因为小智走的时候说是2个小时以内回来，可是足足去了近5个小时！要不是知道小智很强，小霞早就想跑去找小智了！
之后小霞和小雪问小智去了那么久收获了什么，小智拿出了两个神奇宝贝球。“小智你收服了什么强大的神奇宝贝啊？”小霞说道！
“打开图鉴，我抓的是138到142号的神奇宝贝。”小智说道。
小霞和小雪打开了神奇宝贝图鉴，找到138号。“不是吧，小智你抓到了这种神奇宝贝吗！”小霞吃惊地说道。小雪也十分吃惊地看着小智。这个少年给他们带来了太多的，不可能了！
“嗯！”小智点点说道，“不要告诉别的人啊，要不然这些化石神奇宝贝的安静生活就要被打乱啦。”小智又说道。
“这个当然了，但是你要怎么处理这两只神奇宝贝呢？”小霞问道。
“送给你！”小子这两个神奇宝贝递给小霞说道。
“什么送给我？”小霞一惊，毕竟这可是少见的神奇宝贝呀！
“当然啦，这两只神奇宝贝刚好是水系，适合你！再说我也还没有送过礼物给你了，这个就当做我送给你礼物好了！”小智微笑的说道。
“小智………”小霞此时也不知道该说些什么好，他只知道有小智在身边她都能感到无比的幸福。
而一旁的小雪见此脸上露出复杂神色，不知道在想些什么。
