联合指挥机构成立了，就在第三十一师师部，各部队的作战部门，后勤部门，参谋机关都搬来这个地方。
在指挥中心的内部还放置了一架太空梭，帝国军无时不刻地攻击联邦军队，在指挥中心的周围，军队分布在四周。
帝国军队的陆战队，开始包围了联邦军队的陆战队，地球联邦军事委员会的命令也传达到了这个基地。
这个命令就是晋升陈禹为中将，担任陆战队指挥官，各师均在他的指挥之下。
帝国舰队再一次地向着地面发射能量束，直接射击在地面上，地球联邦军的英勇抵抗，使得帝国军人震惊了。
联邦军的士兵抓着帝国军的机甲战士，用刺刀刺了进入，直到将其杀死，这几个师的官兵们组成了一个半径达到四十千米的防御圈。
在圈子的中心，就是联合作战指挥中心的所在，陈禹正在思索着冥王星应该想着何处去的时候，要塞大炮也做好了再一次发射的准备。
能量开始向着炮口集中填充，绿色的光再一次充斥着炮管，在炮管的周围，绿色的闪电开始出现了。
能量填充完毕的大炮的炮口出现了一条长长的能量束，这些能量束轰在了包围冥王星的帝国舰队的身上。
使得在冥王星的帝国飞船受到了惨重的损失，十多道能量束，轰出了十多道缺口，从里到外的船舰都被轰毁了。
出现了十多道缺口，在外面的联邦补给舰队从容地将物资运抵冥王星，其中就包括冥王星的要塞炮所需要的能量块。
这种能量块必须在反应堆内释放出来，填充到要塞大炮内，要塞大炮不断地发射着，帝国舰队损失了上万艘的战舰。
阿维尔将军愤怒了，对着无能的下属怒吼道：“你们平时的学识都哪里去了，我们受到了这么惨重的损失，尽管人类的损失比我们大，但是，这让我们无法接受，我们被这些应该被消灭被奴役的小把戏消灭了这么多。”
他的参谋长告诉他，地球联邦的军队已经做好了自杀性攻击的准备了，拿整个冥王星来阻滞我们前进的道路。
阿维尔将军愤怒了，他愤怒地说道：“这些臭人类，我一定要消灭他们，杀死他们，然后要把地球占为己有。”
帝国军先锋舰队继续包围着冥王星，但是人类的士兵已经做好背水一战的准备。
正在地球上，联邦科技大学，请来的工程队正在搬迁学校内部的设施，飞船已经将学生和他们的家属全部搬迁到了方舟舰队的旗舰内，安排在保密度最高的S区里。
专家教授学者和科学家们也已经转移到了星之海灵号的内部，他们开始了研究工作，林洋这个时候还在陆地上。
他要等待他的父母和弟弟，准备一起走，他希望将地球上的科学家大多数都带走，新的文明需要他们。
就在林洋在自己的别墅里踱着步，父母回来了，看到自己的儿子站着，连忙问道：“学校的事情办妥了吗？”
林洋回答道：“办妥了，设备正在搬迁，所有的学生和教职工人员，还有专家学者，科学家们还有他们这些人的家属，都已经上船了，还有一批士兵。”
林辉煌道：“很好，全世界的科学家还有他们的家人也会出现在星之海灵号上的。”
林洋说道：“你们也跟我走吧，你们也是科学家，人类的未来需要科学，就是在这漫漫的逃亡路上，科学更加重要。”
就在林洋和父母对话的时刻，在遥远的冥王星上，激战仍然在继续着，陈禹将军的部队在冥王星的中部开始组织反击。
帝国军先锋舰队的陆战队放下了三分之一的兵力，这些部队要比地球联邦驻扎在冥王星上的陆战队兵力还要多。
但是帝国军的官兵看到了人类在绝望时爆发出来的强大的战斗力，导致了帝国军队的巨大损失，感到震颤。
阿维尔将军带着颤抖的语气说道：“参谋长，快去命令部队，消灭这些该死的老鼠，快点去，多派陆战队啊，你们难道要让我们拖死在这里吗？”
参谋长接令之后，立刻去部署了，又有三个陆战团下到了冥王星的表面，冥王星上，到处遍布着地球军官兵的尸体和帝国军士兵的残骸，冥王星的表面血流成河，很多地面别血染成了红色。
地球联邦军的抵抗仍在继续着，只是由于兵力的减少而收缩了防线，这个阵地圈缩小到了直径只有不到二十千米，但是对抗仍在继续着。
人类的战车依然在突击，躲在战车里射击的官兵们，随着战车被摧毁而牺牲了，帝国军队又派下来三个团，加入了对陈禹部队的围殴。
陈禹已经顶不住了，就在陈禹他们在商讨如何撤退的时候，冥王星的丧钟敲响了。阿维尔将军看到投入了这么多的部队，还是无效。
他下令，将地面上的部队全部撤回来，用反物质炮弹摧毁整个冥王星。
三艘战舰装载着巨大反物质炮弹朝着冥王星的三角前进着，在三个方向上同时放出反物质炸弹，就可全部摧毁整个冥王星而留不下一点渣滓。
在血战中的地球军队无法得到更多的补给，仅有的一点补给被消耗完了，这距离冥王星保卫战的开始仅仅过去了二十个小时。
冥王星战役，使得地球军受到了惨重的损失，两个陆战师几乎被消灭干净了，从火星调来的三个师也损失过半。
就在地面的上的部队高声欢呼着敌人的撤退的时候，灾难发生了。
敌舰的三艘装载着反物质炸弹的战舰已经达到了自己的战位，三枚反物质炸弹已经放置在发射口上，三艘战舰的舰长同时按动了发射按钮。
嗖，嗖，嗖，三枚反物质炸弹发射了出去，在地面上守卫的士兵看到三个大东西径直朝着地面飞来，他们达到了几公里的直径，官兵们看到这三个东西越来越大。
这三枚炸弹越来越靠近地面，官兵们这才意识到大事不妙了，这三枚炸弹在距离地面五百米的高空爆炸了。
冥王星这个矮行星没有多少抵御反物质的能力，它的表面就像是一层砂纸一样被扒开了，陈禹喊道：“快进太空梭。”
说完带着三位师长和司令部的人员钻进了太空梭中，一眨眼，太空梭便起飞了，司令部的人员并没有像地面的官兵们死在了现场，因为他们没有时间躲避这种巨大威力炸弹的攻击，而这艘逃难用的太空梭却有着强大的防御装置。
就在冥王星被摧毁的那一刻，十几门星球要塞大炮发出了它们的最后一击，十多个直径四十千米的绿色能量波束发射了出去。
十多个带着巨大能量和杀伤力的波束，带着死神的问候，击杀了数千艘的敌军战舰，太空梭就进入了能量波束攻击过的地方。
因为能量波束的攻击却打通了冥王星与外围的通道，冥王星消失了，变成了一堆漂浮在太空的瓦砾。
陈禹中将看着逝去的星球，黯然泪下，对着展翼，迈尔斯，何文说道：“冥王星完了，数十万官兵完了！”
看着仅剩下的数百人，陈禹无法控制自己的感情，失声大哭。
冥王星的毁灭传到了国会大楼中，国会大会议室中通过网络直播的战场消失了，屏幕上的一切都变成了原点。
议员们震惊了，这说明了冥王星被摧毁了，但是他们又得知，陈禹等指挥员活了下来，国会接通了陈禹的太空梭。
陈禹哭丧着脸，对着地面上的人说：“敌人使用了反物质武器，冥王星已经成了一片碎石带。”
碎石带，这里的意义，国会议员们都知道，冥王星不复存在了。
陈禹向着总部汇报，敌人舰队下一个目标有可能是土卫六，因为那里也部署着联邦部队，还有大量的居民。
就在这个时候，陈禹接到了国会的命令，让他们到地球上接收新的部队，到火星上部署。
林洋在别墅里，接到了冥王星被摧毁的消息，整个冥王星战役进行了仅仅二十个小时就结束了，是以一个星球的毁灭而结束的。
在恭王府内，科学家委员会主席团的全体成员开始进行会议，林辉煌道：“我们应该撤离这里，因为我们现有的实力没有对抗的可能，军队的对抗只是会延迟敌人的进攻，而且进攻的仅仅是敌人的先锋舰队，还有主力舰队和搭载着平民的运输舰队，我们无法抵抗，即使我们能够打个平手，也无法阻止敌人舰队主力的进入，而且在技术上，我们全面落后于他们，尤其是在武器上，更是落后，虽然我们有了反物质推进技术，但是我们没有能力将反物质转化成为武器的能力啊，如果这场战斗能够推迟二十个月进行，战争的胜负就可以决定啦。”
马斯说道：“林先生说的有道理，虽然我们的努力使得战事会胶着一段时间，但是终难持久。”
林辉煌道：“所以，通知下去，所有的科学家，心理学家，哲学家，文学家，还有农业学家，以及技术工人，工程师，工人，技术农民，文化学家，音乐家还有艺术家都到飞船内集合，各大洲的人除了科学家外，就近安排进入哪艘飞船内。”其他人都点了点头，这就散会了。
就在帝国舰队朝着海王星附近的人造基地前进的时候，在地球上，一场极其秘密撤离行动开始布置了。
各地的方舟部队开始运作，他们的每个官兵的手上都有一份撤退人员的名单。就在帝国军与海王星轨道的基地鏖战的时候，伦敦，纽约，旧金山，东京，上海，北京，重庆，莫斯科，新德里，孟买，巴黎，罗马，约翰内斯堡，巴西利亚，布宜诺斯艾利斯等全世界的各大城市，方舟部队的官兵正在搜索着世界的精英们。
在伦敦西区的一幢别墅中，这是一个理论物理学家卢卡斯的住所，突然一阵急促的敲门声。
卢卡斯打开了自己的大门，看到了一群荷枪实弹的军人，一位中尉说道：“你是卢卡斯先生吗？”
卢卡斯点点头，然后，这位中尉说道：“带上你的家人和生活用品还有你的学术资料，跟我们走。”
卢卡斯问道：“这是为什么？”
中尉说道：“这是科学家委员会的命令。”
听到了科学家委员会，卢卡斯明白了，几位大佬已经做出了撤退的决定了。
卢卡斯对着中尉说道：“我们可以跟着你们走，但是我要收拾一下。”
随即去了卧室，开始叫家人去收拾东西了。在全世界的各个地方，方舟部队带着各行各业专家能手们离开了地面，进入了方舟舰队的内部。
在海王星轨道上，十多个人造基地开始移动，他们要集结火力共同抗敌，基地的驻留舰队，驶出了基地，开始参加战斗。
但是反物质炮弹带来的好处显而易见，一枚反物质炮弹就结束了这些基地的生命，海王星沦陷了。
这仅仅是两个小时，后面的天王星轨道上的太空基地群还没有部署完毕，基地仍在调动。
军事力量的部署还没有结束，基地内部的驻留舰队还有相当一部分正在维修，而天王星的基地大部分是后勤基地，主要是储存中转补给物资和维修战舰，训练官兵而已，没有太多的战斗力。
但是这些基地依然装备着基地大炮，还是有一些杀伤力的，这些基地开始集中，帝国军已经决定使用反物质弹来对付这些基地。
二十多个基地已经集结了起来，基地大炮开始射击，粗壮的能量炮束射了出来，打在前导舰上，最前排的战舰被消灭了。
两枚反物质弹发射了出来，正当基地大炮正在填充能量的时候，反物质炸弹爆炸了，这些基地也灰飞烟灭。
仅仅一天多的时间，敌军就攻克了天王星，海王星和冥王星，逃亡已经是不可避免的，各行各业的专家学者，工程技术人员，技术工人和技术农民还有各高校学生都已经撤退完毕，世界各地的中学生和他们的家属也撤退完毕了。
现在开始撤退平民，被选中的幸运者将撤走，冥王星上残骸依在，海王星，天王星又出来了新的残骸。
看到显示屏上显示着这些残骸的影子的时候，国会议员们的心震颤着，以后怎么办，如何进行抵抗，如何进行战略动员等等，这些问题都放在了国会议员们的心头。
就在三颗星球同时沦陷的这一天，科学家委员会主席团的成员在星之海灵号内部的S区中心殿堂开了个会。
林辉煌被众人挽留了下来并且被推举为S区的委员会主席，领导这里的科学研究。
就在这个时候，林洋和他的弟弟林潮看到联邦科技大学只剩下下了一堆空荡荡的建筑的时候，心终于平了下来。
在撤退的时候，所有的科大人员和他们的家人第一批撤退进入了飞船，科大，只能在飞船中继续进行教学和科学实验活动，但是飞船内部广阔的空间使得教授们感觉这里比地面上还要空旷。
地球上的人类，开始慌张了，一天多的时间连续丧失了三颗星球，土星的基地群开始朝着土卫六的附近集结，地面上开始发生了恐慌。
股市在几分钟内一下子下跌了三千点，整个一天连续下挫了数万点，跌到了一万点以下，商业贸易停止了。
人们开始恐慌，难道那些蓝色皮肤的外星人，要成为地球的主人吗？
大家开始走后门，找门子，希望够躲入海底基地，此时，对于撤退平民的筛选已经结束，那些有着一技之长的人进入了候选之列，大多数都得到了撤退的证件。
方舟军团在联邦民政部门的秘密战士，他们挑选了上百亿的平民，那些人有百分之八十的人获得迁徙进入方舟舰队的权力。
撤完了平民，他们开始秘密地撤退政府官员，一些公务人员也开始在方舟部队的逼迫下，撤退到了方舟舰队的内部。
整个舰队如同一个巨大的分区的空间，内部也是浮空车来来去去，在居民区，也就是每一艘飞船的K，T，C，E等区。
民众们开始了逃亡前的准备，也就是方舟军团的军人教授他们如何在逃亡中进行生活。
在地面上，各种打砸抢的事件应接不暇，社会治安顿时恶化，幸好林洋和林潮的身上带着自卫的武器。
就在土星和木星附近轨道的基地，开始朝着土卫六的轨道集结的时候，外星舰队已经进入到了距离土卫六不远的地方了。
他们开始了对土卫六地面的攻击，土卫六是宇宙舰队的主要基地之一，那里有着巨大的舰队维修基地，后勤保障基地，还有战舰工厂。
如果土卫六沦陷，那么宇宙舰队的维修和生产能力将下降三分之一，这对地球的安全，是不利的。
宇宙舰队的司令科里急了，接连朝着土卫六基地发送了一连串的命令，命令他们，如果战败，就要毁掉整个基地，不能让这些外星人获得一颗螺丝钉。
帝国军队开始朝着土卫六基地发射能量炮，能量波束经过的地区都是村毁人亡。土卫六上生活的平民大多数都开着自己的飞船撤回到了地球上。
这些失去了自己土地和家乡的平民正好就是撤退平民的来源之一。
土卫六上的抵抗，是宇宙舰队在外太阳系最后的抵抗行动，在这个时候，宇宙舰队的第三，第四，第六舰队突然毫无征兆地朝着小行星带移动。
第十三舰队也开始向着小行星带前进，这个开进也是方舟计划的内容之一，就是要让逃亡舰队能够顺利地通过小行星带，而且这些舰队在开路之后，直接加入方舟舰队。
