黄帝于荒野之中不辨方位，九战九败，直到风后进上指南车为止。黄帝借助此车走出迷途阵，就遣使再往昆仑山求援。王母派来玄女授下六甲六壬兵信之符，制妖通灵五明之印，五阴五阳遁元之式，五兵河图策精之诀。
黄帝籍此重整旗鼓，排兵布阵，大破神荼郁垒的混元迷途阵，驱散了重重迷雾，活捉了神荼郁垒。从神荼郁垒口中，黄帝得知了一个惊天的秘密。原来天帝太一挑起战端，使天下大乱不是太一的根本目的，太一正着手策划一个一统天地人神鬼的天道系统。太一占据了天宫，但是没有能力统一天下诸灵。为了能尽快达到目的，太一就暗中在天柱不周山曾经自己藏身之地的地极之渊开始修建地宫，地宫之大，绵延整个地下，太一将世上所有之血收集在一起，汇成血海，在血海之下的地宫中设立聚灵台，凡是脱离肉身的幽灵无不被聚灵台上的神幡给招来。在地宫之中已有阴兵百万，等到太一能汇聚阴阳、颠倒乾坤之时就可以令天兵天将与阴兵阴将齐出，将世上所有之上古精灵收复或消灭，神荼郁垒就是在泰山地宫得到太一的命令随蚩尤出战的。
黄帝得到消息大惊失色，忙将消息传给天下各仙山。众仙聚会于昆仑山商议对策，大家都愿助黄帝一臂之力，诛灭蚩尤。
有了众仙的支持，黄帝便下定决心与蚩尤决战于逐鹿。黄帝率应龙貔貅祝融女魃迎战蚩尤风伯雨师，真是个风雨如晦、火光冲天，血流成河，大战惊天动地。蚩尤军在黄帝分割瓦解之下迅速土崩瓦解，风伯雨师的风雨在女魃面前无计可施，只能狼狈逃窜。最后蚩尤身边仅剩下八十一名兄弟，这八十一名兄弟个个以一当百，硬是从重围之中杀到黄帝眼前。若不是应龙祝融保护，黄帝几乎就要被蚩尤抓住。蚩尤看到自己的兄弟一个个倒在血泊之中，仰天长啸，变作高有百丈、三头六臂的巨人，挥舞着蚩尤之剑、蚩尤之斧、蚩尤之矛，所向披靡。黄帝见蚩尤铜头铁额刀枪不入水火不侵，又一路追着自己打，知军中无人可敌，只得将蚩尤引到鸿蒙大泽之中。这鸿蒙大泽是天地未分时就有的，泽内曾孕育出无数的上古精灵，是天地灵根一脉，如今这里是女娲之仆螣蛇所居之地。蚩尤追黄帝到此陷入大泽之中，泽内顿时瘴气毒雾弥漫，蚩尤无法抵御鸿蒙大泽深厚的瘴沥之气，瘫倒在大泽之中，螣蛇将蚩尤绑缚交给黄帝带回。
黄帝命将蚩尤斩首号令三军，可惜凡兵利刃根本伤不了蚩尤分毫，王母赠给黄帝一块昆仑神铁，伏羲用文武八卦之火煅烧百日，炼出一把神剑，黄帝用奇珍异宝打磨装饰终成一把神兵利器，命名为轩辕剑。黄帝就用轩辕剑将蚩尤头颅砍下，又将蚩尤头像画在旗帜上以壮军威。
黄帝打败蚩尤，一统中原，这下惹恼了另一位部落酋长刑天。刑天举全部族来与黄帝决战，为使天下信服，黄帝决定亲自出战。黄帝手执轩辕剑，刑天舞动干戚，两人从泰山打到华山，从华山打到常羊山，刑天勇武绝伦，黄帝智慧超人，再加上轩辕剑威力无穷，两人竟打了个平手。黄帝见刑天斗志昂扬，越战越勇，不禁心中佩服不已。此时应龙居云上观战，见黄帝没有胜算，便暗中降下雨来，那雨中夹杂着巡天飞剑，专往刑天眼上戳。刑天看有人偷袭，好生气愤，将利斧飞出去击应龙，应龙见势不妙，展翅飞走。一刹那黄帝轩辕剑已经落在刑天脖颈之上，刑天头颅应声而落。黄帝见胜之不武，有些愧疚，又见没有头的刑天躯体依然舞动干戚不止，更加心生敬服。黄帝以轩辕剑开山刻碑，将刑天头颅隆重葬于常羊山。
自此天下安定，黄帝遂在泰山封禅，黄帝的文德武治使天下苍生感佩。
天帝太一又一次挫败，但也从中得到很多好处，在幽冥界攒下很多能征贯战的大将。为了壮大地宫势力，太一需要更多的幽灵来供自己驱使，于是天灾不断，魑魅魍魉、猰貐、凿齿、九婴、大风、封豨、修蛇等妖魔鬼怪为祸人间，致使民怨沸腾。更有甚者，天上十个太阳一起出来，致使地上寸草不生，生灵涂炭。其时帝尧为君，帝尧命神射手后羿造射日神箭，后羿乃取昆仑山蟠桃藤为弓，取南极玄凤羽为弦，取北极玄冥寒铁为箭，诛凿齿于畴华之野，杀九婴于凶水之上，缴大风于青丘之泽，断修蛇于洞庭，擒封希于桑林，最后张弓射日。后羿瞄准一个太阳一箭射去，太阳中箭而落，每射掉一个，天气就清凉很多，还剩最后一个，后羿轻蔑的一笑，说了声再见，一箭射去，那箭却都被太阳给融化了，根本伤不到太阳分毫，再射依然如此，后羿不知道这最后一个太阳是盘古眼睛所化，不是天帝所造，连天帝也无可奈何，何况后天利器。太一看到自己炼化数万年才炼化的九只三足乌被后羿射杀，那种日月交汇天翻地覆的情景再次映入眼帘，不禁怒火中烧。为了惩罚后羿，天帝太一命妻子常曦将后羿妻子嫦娥诱骗到月宫中，让后羿先尝一尝人间最大的悲痛，然后再杀。常曦先使人散布流言说昆仑山王母娘娘处有不死灵药，吃了便可以飞天。后羿立下大功，受万民敬仰，因此有人怂恿他去要不死灵药，否则对不起自己大羿的称号。后羿血往上撞，来到昆仑山见王母说要不死灵药，王母不想使这位人间的大英雄失望，就取出由蟠桃炼化的增寿丸给后羿。后羿拿着不死灵药回到家中，让嫦娥保管好灵药。常曦不失时机的将灵药调包，并诱惑嫦娥吃下，嫦娥吃下果然身健体轻，飘飘欲仙，在常曦的引导下嫦娥来到月宫，之后才发现月宫中既孤寂又寒冷，想要回到人间却不可能了，这才知道自己被囚禁在月宫中了，只能每日以泪洗面。后羿回到家中不见了嫦娥，猜想一定是嫦娥偷吃了灵药，丢下自己去天宫享乐了。后羿愤恨不已，伤心欲绝，来到洛水之畔，正要投河自尽，忽然听到水上传来凄凄婉婉的弦歌之声，只见一个素服的美貌仙子在水上自弹自唱，后羿踩水走过去问是何故。那女子见眼前的男子英俊潇洒，果敢刚毅，眼神中又有无限忧郁，便有同病相怜之感，就说自己名叫宓妃，因为善弹七弦琴，便在洛河之畔演奏，不想惊动了河伯，那河伯看到自己貌若天仙，便强行掳去水府深宫中，又逃不出河伯的神力，只能终日郁郁寡欢，用音乐排遣愁苦，今日正好河伯去参加五渎盛会，自己才能到水面上看看风景，不禁触景生情。后羿听完，义愤填膺，发誓要替宓妃讨回公道。那宓妃看后羿正是心中盼望已久的意中人，后羿因为爱侣遗弃，也想找个感情寄托，两人就在水上互诉衷肠，很快两人就陷入爱河不能自拔。河伯回来发现不见了宓妃，就四处寻找，正看到宓妃与后羿两人在岸边卿卿我我，搂抱在一起。河伯怒不可遏，变成一条白龙兴风布雨的就要将后羿吞噬，后羿不慌不忙，取下神弓，搭箭射去，正中河伯左眼。河伯这才知道这人正是那能射日的神射手后羿，知道不是敌手，就捂左眼逃到水底不敢出来了。河伯本来也是太一分封的地下诸神之一，虽然各仙山洞府不承认，但还是有些权柄的。
另一面太一为笼络人心，也会做些通神的事情来，比如只要忠于天帝，勤于供奉，天帝还是会酌情挑选一些凡人到天宫任职的。而在地下，幽冥地界，太一也仿照人间设置各司各镇来管理幽灵，不允许幽灵擅自附在生人或死人身上，凡投胎附体的都得有部籍写明。但也有强大幽灵不服太一管辖，太一就给予特别的礼遇，让其任司命之主，统辖万物生灵。那时能招魂纳魄、驱使鬼魂的神魔遍地皆是，唯有太一这地宫为最大，只因太一拥有籍日月得天独厚之精华练就的创世奇宝东皇钟，太一创天宫地府多以此钟来震慑部属、护卫灵界。而唯有这天地之间以人为万物之灵的人间界，太一又无力统辖，只因其中有太多浑沌之时的精灵，这些精灵多闲居在各大山川水泽之中，能力与自己相当甚至高过自己的不在少数，只能一边分化瓦解他们，一边积蓄力量，以待时机。
此次后羿射日之事，太一本要先惩戒后羿，没想到后羿因祸得福，抱得宓妃美人归，真真是气煞人也。太一就发了天威，命人间受命于自己的水神火神风神山魈林怪以及幽冥神鬼无论如何都要将后羿置于死地，并投入地狱受无边炼狱之苦。
这一下人间就又乱成了一锅粥，这些精灵早就按耐不住暴戾的本性，身后又有太一做主，更加肆无忌惮，不分青红皂白，携风带火，以致到处洪水泛滥，天火滚滚，风助火势，民不聊生，人间已成地狱。
