甘辉语成功：『瓜洲、镇江，南北咽喉。以我守之，山东之师不能下、两浙弗通，金陵可坐定也』。成功召诸将议；潘庚锺、冯澄世皆请毋轻进，曰：『北京满、汉之人数十万，待漕而食；我扼其径，不两月将致变』。成功曰：『时有不同，若我自老师，援兵四集，首尾受敌，危矣』！张煌言以书促之。癸已，登舟传檄远近。丙寅，至观音门，使黄安垒三囗〈氵义〉河。戊辰，使罗蕴章招苏、杭。己督诸军屯狮子山，列其舟于江东门；自以亲军数十徼城下，相形势。使林明、林胜、黄昌、魏雄、杨世德军旱西门，马信、黄昭、萧拱宸援之；使陈鹏、蓝衍、蔡禄、杨好屯东南，阻水壁；使刘巧、杨正、黄应、戴捷、刘国轩屯东南山麓，使张英、陈尧策、林习山屯岳山，以为卫；以甘辉、余新军狮子山，万礼、杨祖屯第二桥，翁天佑军仪凤门，深沟树木以围之。亲祭孝陵，操文激烈。梁化凤之降也，成功未使从；化凤潜自丹阳入金陵，与郎廷佐共守之。乙亥，廷佐以骑军数千出，余新击败之；城中益惧。朱衣助既被获，成功鄙其人，纵之；衣助告廷佐：『成功兵不数万，请绐之以待援』。乃伪降，曰：『逾月，则妻子得免死』。潘庚锺、甘辉訾真伪，与张煌言皆谏；不听。
余新轻锐，士卒樵者，空其壁；或浮后湖嬉。甘辉力谏曰：『严城师老，猝不得拔，必有变』。余士信再言之，乃勒兵三日必入城。有管甲吏犯法，叛告廷佐曰：『翌日成功诞，诸将必贺。请急袭之。不然，必败』。且请为导。乃凿神策门出。秋七月癸未，梁化凤、哈哈木首攻新壁；新不及甲，走萧拱宸军。拱宸部亦惊溃，新被执，翁天佑援之不及；廷佐尽其骑兵出。甘辉、潘庚锺请退军观音门，围再举；成功不可。使姚国泰、杨祖、蓝衍、杨正阵山上，甘辉、张英伏林谷，林胜、陈魁阵山下，陈鹏、蔡禄军游击。哈哈木、梁化凤攻杨祖，祖力战，三合三却；杨正、姚国泰亦败，蓝衍战死。山高而阻，陈鹏、蔡禄不及救。化凤驰下，忽被却；廷佐急使骑兵夹攻之。成功兵望山上麾盖植不动，不敢退，亦不敢救。林胜咋而谓金岸、康龙曰：『敌无多骑，藩王不合击，误矣。尔死战，吾助尔』。龙、岸共搦化凤战，骑兵忽后至，胜还御之，魏雄战死。成功鸣鼓收其军，步伍犹不乱。化凤、哈哈木纵，郑师不能止，乃大溃。成功方语潘庚锺，自往促水师；比及江，望诸军迸如雨。知不可为，乃顺流走。庚锺以护卫军力战，至死不去其盖。陈魁援成功于中军，亦败没；张英中流矢死。甘辉斗且走，左右皆尽；所杀亦数十人，马蹶被执死。诸将龙操、朴世用、洪复亦战死，惟左右护卫镇、右虎卫镇、右冲锋镇、援剿后镇凡六军得全。
成功至镇江，黄安军亦至；益之以周全斌诸军，犹数万人。成功大恸。将自镇江归，诸生罗子木抱其足，请及其不意再攻之。成功不可；弃瓜洲、镇江，军于排沙。使马信、韩英截江口，周全斌、黄昭、吴豪殿，以次毕登舟。八月，至崇明；梁化凤复入守。成功力攻之，城崩数十丈，化凤死守。乙亥宵，梯之；韩英、王起凤中炮死。周全斌曰：『多杀士卒，无益也』。罗子木以父被执，弃成功去；旋归张煌言。马逢知谋亦泄，黄征明等被执死。成功乃东。
九月，朱成功至宁波，将攻之，垒于定海关；不得入，乃旋师。至舟山，拔之，以陈辉、阮美、罗蕴章留守；己还厦门。其将刘猷征饷温州，水浅舟胶；骑兵骤至，力战不支，一军皆没。
冬十月，朱成功至思明州。哭甘辉而后入曰：『吾早从其言，不及此』！上表永历帝，以败军请罪。庙祀死事诸将佐。
顺治十七年（永历十四年）夏五月，明安达理出浙江，达素、李率泰出福建，共攻朱成功；以其屡出也。明安达理军遇疫，死者过半。达素以大舶出漳州、别舰出同安，许龙、苏利、吴六奇皆来会。成功使陈鹏军高崎、郑泰出金门拒苏利，自督诸军当达素。陈鹏忽变，请自五通入金、厦，己为应；成功不知，方椗海中，按兵以待。漳州舟大，乘风骤至，周瑞、陈尧策战死；陈辉被攻，急烧火药以拒之。攻者踊入，却；辉得免。日加午，成功问曰：『潮平乎』？曰：『平矣』。曰：『平则转，转则风』。下令举椗。风果大作，成功手自搴旗起，麾巨舰横冲之；郑泰亦自浯屿出。军士呼声震天地，波涛吼立，海水皆动。达素大溃，成功纵击之；僵尸蔽海。有满洲精卒数百走圭屿，成功折箭招之降。率泰恃鹏应，挥军直进；鹏戒其部无动。陈蟒骇曰：『事急矣』！挥军进，炮作。陈璋以为鹏战也，亦鼓噪出。率泰兵不支，退入于淖；蟒、璋共攻之。鹏知失计，亦伪出，擒哈唎土星及诸校，两路皆大捷。成功磔鹏，以蟒代。吴六奇后二日至，闻败遂还；达素走福州。自是，无或议金、厦者。
率泰又先贿成功之厨者，使毒之及诸将。其徒王四将置毒而身栗，止则否；如是者数。告其父耀；大惊曰：『事主而害之，不忠；诺而背之，不信。然可负信，不可以不忠』。首之成功，杀厨而赦四父子。率泰曰：『天也』。
成功寻攻广东，兵以刀牌相继进，一人鸣鼓以号之。鼓震，则疏立；马军至，急绕袭之：是以辄胜。张应元以铁棓击之，乃旋师。
顺治十八年（永历十五年）春正月，朱成功在思明州。崎岖海澨十余年，无所得；又苦金、厦弱，谋他适。有何斌者，以取台湾说进。台湾在海中，横亘千余里。隋以前，无闻；大业初，虎贲中郎将陈棱履澎湖而返。宋为毗舍那国。元设巡检于澎湖，无居台湾者。明初，废巡检。嘉靖中，海贼林道干止其地；寻被逐于琉球。天启中，日本又逐琉球而有之。郑芝龙纳倭妇室于此；寻入降。荷兰以求香山求澎湖于明而不得，乃重啖倭，就台湾求一互市地。旋诱以天主教而有之，筑赤嵌、淡水、鸡笼凡三城及炮台。值闽大旱，芝龙请于熊文灿，以舶徙饥者往垦之；土膏产众，闽民麇至，广立村市。荷兰惟治市舶，不之问。及成功时，荷兰市益利，占城、吕宋舶皆道此为都会，置揆一王守之。斌为之主计；会蚀其息二十万，乃说成功曰：『公虑思明弱，曷不取台湾乎！其地键四省，产饶，又富硝磺、铜铁；得台湾不虑无兵饷，且固君家土也』。因以图进。
成功览之，慨然曰：『此亦海上扶余也』。集众议之，竟日不能决；惟马信、杨朝栋请行。乃使洪旭、王秀奇、黄廷辅其子经守诸岛，己亲行。
二月，至澎湖；下令曰：『视吾鹢首而行』。至鹿耳门，台湾之外障也；沙淤水折，荷兰又沉大舶阻之。乃祝天曰：『成功受先帝命，寸土未得；天果佑之，敢以水请』！潮涨逾十尺，乃使斌按图先，金炮齐作。其酋方持镜窥郑师，曰：『唐船及炮台，必无遗矣』！而成功舟倏东北，群舟挟潮衔尾翔溢，或无当炮。酋骇呼其党英黎三截击之，不及阵，成功已拔赤嵌城。明日，其揆一王阵七鲲身，杨祥以藤牌卒跳荡击之，荷兰大败，走入城；攻之弗克，为竹篱、炮台环七鲲身而围之（鲲身者，海沙也）。
秋七月，降将黄梧诱郭义、蔡禄以铜山降。成功微闻之，急告洪旭檄两人之台湾；义将行，禄言『藩王疑我，汝能无恙乎』？义犹不忍叛；其党万五卓刀誓必走。乃伪为许龙军防四城，并劫张进降，不可；禄、义自八尺门降。黄廷、陈豹追之不及，设守而还。
成功围荷兰城犹未克，土番阿德狗忿杨高虐，杀之；杨祖往讨，败而死。且将应荷兰，黄安诱斩之。
冬十月，郑芝龙伏诛，并其子世恩、世荫、世默，无少长皆死。李率泰复迁方田、排头、香港八十八堡民于内地，禁商舶、渔船毋入海；距海三十里无人迹。春燕来归，巢于舶上，商民大困。
十二月，朱成功攻荷兰城，犹不下。其城皆乱石煅火而成，炮矢不能入；已焚其夹板船，亦不去。然荷兰纔千人，环而居者率闽产；其父老说成功曰：『城无水，仰诸南北山；塞而断之，必困』。从之。且语荷兰曰：『是我先人土，予我城者，器用他物不汝校』。荷兰乃迁去。
成功入台湾，以为东都；字赤嵌为「天兴府」，使郑省英为府尹。立县二：曰天兴、曰万年。亲巡里舍、锡之蔫布，番民尽服。使刘国轩、何斌、吴淑为典兵，水陆训练；大兴屯田，按镇分地，即地垦田。教以牛耕，诛茅竹为塍社，尽以火。兵补正伍三年，而后税之；曰：『居常而耕、临警而出，此即「寓兵于农」也』。诸将大善之。礼闽人陈永华为谋主，掌书记；永华为约汉夷、制文武、宣律令、兴学校、起池馆、修战备。成功曰：『使吾徇诸人说，不得此一块土，何以武为？今沿海万里无君而望哭者不可计，皆以吾故。至今当移残黎辟土养锐，以待天下之清』。乃益辟诸荒土，招惠、潮、漳、泉之民塞之。待宗室遗臣有加礼，台湾称治。惟用法严；马信谏。曰：『立国之初宜若此，后之守者自易耳』。
诸将陈文达、阮禄等四掠温、台、闽、粤间，苏纳海等遂再迁沿海民入内地，尽弃各省岛屿不之守。
康熙元年（是岁永历帝亡，台湾犹称永历十六年）春二月，有谮陈豹于朱成功者，曰：『是通于尚可喜』。成功使周全斌击之。豹军澳门，与吴六奇、许龙、苏利大小数百战，畏之如虎；至是，集其部曰：『是必奸人反间我也』。众曰：『白诸』。曰：『不及』。曰：『拒诸』。曰：『是真叛矣！我从郑氏数十年，惟天可表此。藩王自惫，非我悸也』。帅其众，赴广州降。不数月，两目俱瞽。
夏五月庚辰，招讨大将军延平郡王朱成功卒。成功感寒疾，诸将犹不知。子经在思明谦恭下士，好学善射，共爱之；生子克囗〈臧上土下〉，乳婢出也。成功怒，使杀之，且及监刑者。又使周全斌自南澳至，众益恟惧。已闻成功疾，曰：『此乱命也』。与郑泰谋曰：『子不拒父、臣不拒君，礼也；君与王为兄弟行，可以行矣』。伏兵大担，诱全斌而执之。时成功疾已甚，犹强登台，持西洋远镜望金、厦诸岛，眷眷不止。庚辰，登台罢冠带，坐胡床，进酒诵「洪武圣训」；及第三帙，叹曰：『何面目见先帝』！以手掩面卒；年三十九。建威伯马信哭之恸，未几亦卒。台人恟惧，诸将奉其弟袭护国事。
袭之私人蔡云、李应清、曹从龙、张骥说黄昭，使立袭；先餂之曰：『公勋高，世子恐不知』。昭有怨词。骥因言：『台、厦已水火，彼岂忘公乎』？昭请谋之萧拱宸曰：『今子也可以拒父，弟不可以承兄乎』？拱宸许之。袭大喜，割襟于昭，定婚媾；遂奉袭称东都王。黄安阳附之，阴语经速济。经及洪旭谋出周全斌为五军都督，陈永华为咨议参军，冯锡范为侍卫；伪使杨来嘉求降于耿继茂、李率泰，羁其兵；自以军东。次澎湖，使郑斌入台湾布告奔丧，众莫敢抗；惟昭、拱宸曰：『经乱国，致先王饮恨卒。护国承诏命，谁敢逆之』！斌还告，经问进军之路于周全斌；曰：『安平天险，请自潦港、洲仔登。萧、黄猾贼知兵，必自守此。然使谕诸将：「叔侄至亲，萧、黄构煽，其各倒戈，共扶王室」；则可以济』。从之，乘雾而攻。昭已先围经垒，经几不支；周全斌呼曰：『今逼水战，大丈夫可死于水乎』？奋身陷阵，昭众反助之，呼声震地；全斌手射杀昭。俄雾齐，全斌急呼：『世子至，黄昭已死』！黄安自阵出，经免冑示之，诸将皆降。全斌急据昭垒待拱宸，复呼于师曰：『罪惟拱宸，众无与焉』！拱宸军皆散，遂执拱宸及蔡云等斩之。
十一月，郑经入台湾，抱袭而哭曰：『几为奸人所害』。待之如初，众大悦。使颜望忠守安平、黄安镇台湾，督诸军；己还思明。其将杨宣居小埕、万安者多溃，总兵林俊奇六十一人皆入降；尚可喜称获成功之弟赐云。
是月，永历帝讣至台湾。张煌言遗经书：使奉鲁王复监国，勉以三矢；经不从，仍奉永历号，自称招讨大将军、延平郡王。以翁天佑为转运使。立肆市、庙宇、新街、横街，并所建置。其将王世鳌则叛降。有陈文敏者拥众海中十余年，至是亦降。
康熙二年（台湾仍称永历）春正月，经至思明州；以内难平，祭告朱成功，申汛守。
待故辽王朱述桂以下有加礼。
夏，郑泰在金门总兵柄，封建平侯。黄昭之死，经得其交通书，秘之；耿继茂亦招泰降，使杨来嘉与约。经闻，欲讨之，虑受敌；陈永华为谋曰：台湾新定，将亲奠之；金、厦无人，泰为郑长，请总制之。铸印以待泰。泰喜，六月诣思明谢；伏发执之，泰缢而死。其弟鸣骏哭之恸，曰：『乃杀吾兄』！引其军八千走；周全斌追之不及。鸣骏出降，封遵义侯；亦封泰子缵绪为慕恩伯。
时成功新亡，复有袭、泰之役，郑氏将佐多生心。江、浙、闽、广四省复有满、汉户兵部郎中各一人，专司招抚；无问真赝，降四级铨实官，或以武资换文秩，人心浮动。于是郑广及忠勤伯陈辉、庆都伯王秀奇、武卫杨富、虎卫何义、都督阮美、郑殷、陈舜穆自台湾，林顺自镇海，周家政自温州，吴升自某岛及文臣蔡鸣雷百余人、将士军民数万先后降；其别部入梁山者，亦为降将折光秋所败，经势衰乱。圣祖决讨经，使约荷兰相助。
