六月戊辰（初二日），平西大将军平西王吴三桂等奏：『臣等收复重庆，即统兵进发。逆首李定国、刘文秀遣伪将军刘正国等率贼众、象只在三坡、红关等处据险设伏，以拒我兵。臣等令马步相兼，步步督战、节节前进，贼遂奔溃。我兵疾追，贼由水道遁入云南。臣等收复遵义府并所属州县，招抚伪总兵及副、参、游等官，计降贼兵五千有余，臣等随抵贵州。有伪总兵梁杰英等拥贼三千有余，屯开州拒守；我兵奋勇分击，贼大败，阵斩贼二千有余，获其象马、器械，遂克开州』。上嘉奖之，命事平日议叙。
辛未（初五日），以赵廷臣为右佥都御史，巡抚贵州（由湖广督粮道参议迁）；以经略大学士洪承畴荐举也。
壬申（初六日），调佟国器巡抚浙江；以苏弘祖为右副都御史，巡抚南赣（由左佥都御史迁）。
丙子（初十日），福建巡抚刘汉祚奏：『提督马得功、梅勒章京傅大受等破海寇于白沙，斩馘无算』。下所司察叙。
两广总督王国光有疾，奏请回旗调理；允之。
辛巳（十五日），以李栖凤为兵部尚书兼右副都御史，总督两广（由广东巡抚迁）。
癸巳（二十七日），浙闽总督李率泰奏：『郑逆拥众直犯温郡，平阳、瑞安俱陷，全浙震动。请敕就近调发江宁满兵援剿，以固疆圉』。下所司议。
秋七月己酉（十四日），以董应魁为兵部左侍郎兼右副都御史，巡抚广东（由刑部右侍郎迁）。
己未（二十四日），谕吏部：『浙闽旧设总督一员，今海氛未息，幅员辽阔，势难兼顾；除见任总督外，着再设一员，分理两省军务。尔部即会推堪任者引见；其各驻扎地方，一并议奏』。
甲子（二十九日），以赵国祚为兵部尚书兼右都御史，总督浙江（由固山额真迁），驻扎温州；改闽浙总督李率泰为福建总督。
八月丙子（十一日），遣章京魏黑、傅达礼、颛塔、萨璧赍敕二道，往谕信郡王多尼、固山额真宗室罗托曰：『固山额真赵布泰等由广西前进，兵力单弱，宜行增遣；除前往每牛录一护军及甲士外，今增遣固山额真宗室罗托所率前锋官兵，并将信郡王所率每牛录护军五名、罗托所率每牛录护军二名内择马力壮者每牛录出护军二名，其章京量所出护军名数拨出，付济席哈率在固山额真赵布泰军营，一同前进。信郡王统领骑兵全军并每牛录护军四名前进。其经略洪承畴，或于贵州之贵阳府，或于他处形胜之地，从便屯扎；将固山额真宗室罗托所率每牛录兵一名、每旗官一员，令梅勒章京一人统领同驻。其余每牛录护军一名、兵四名，罗托领之。俟信郡王军至，即还驻荆州。尔等身在彼处，知地理远近；此三路进兵，必须度量程途、约期并进，毋得参差，致有疏失！其一切进取机宜，未可悬度指授；尔等择便相机而行。凡事，悉与经略洪承畴商酌。往广西官兵或少马匹，可将罗托下将士之马照数给发；其所给马匹，明白造册送部。今自京城已发有马匹往罗托军中，到日分给将士』。谕固山额真赵布泰曰：『兹遣固山额真济席哈与其同往之梅勒章京等及罗托所率前锋官兵每牛录护军二名，往益尔军。至日，尔与固山额真济席哈暨梅勒章京等，凡事公同商酌。其进取机宜，未可悬度指授；尔等择便相机而行。敕书到日，可即驻师；俟济席哈等至，一同进发』。上复面谕魏黑等曰：『尔等至彼处，可齐集两王、贝勒、贝子、公、固山额真及夸兰大等，谕以抚循士卒，当如父之爱子。行军必敬慎提防，谋事无失；毋得骄矜躁急，致有疏虞。夫士在行间，固当有进无退；而克敌制胜，有贵惧以成谋。前敬谨亲王及讷尔特等之败，皆以轻敌躁进故也。至投诚之人，当分别其倾心效顺，或事急来降。即事急来降者，亦皆当收养；纵有逃亡，听其自去：始足彰我恩育之仁。夫以威服人，何如以德服人之为愈也。其平西王、固山额真墨尔根侍卫李国翰等，亦以此意谕之』。
吴三桂奏：『伪兴宁伯王兴为李定国调赴云南，将卒家口留驻绥阳。臣兵至桐梓，兴子伪总兵王友臣差伪中军朱尚文迎赴军前投顺；兴亦自云南脱归谒见。又有伪侯、伪将军等共带家口七千余及水西宣慰使安坤等投诚』。
乙酉（二十日），逆贼谭诣等率众犯重庆，命总督李国英统官属兵丁入川扑剿。
浙江巡抚陈应泰奏：『八月初九、初十等日飓风大作，贼船飘散；官军瞭其所向，分兵追剿；当阵生擒及投诚共九百余名，并获关防、器械、甲马等项。逆贼子属沈溺，丧气归巢』。得旨：『探明逆贼郑成功的在何处，相机图剿。其有功人员，着议叙』。
冬十一月甲午朔，福建巡抚刘汉祚奏：『海寇窃踞永宁、崇武等澳，联〈舟宗〉飘忽，屡犯洛阳内港等处。提督马得功遣参将宁献功等进剿，获斩无算』。
十二月壬午（二十日），江西巡抚张朝璘奏：『故明宗姓朱议滃、伪都督王佑、伪经略彭坤等及伪文武官百余、众三千余人投诚』。
戊子（二十六日），命固山额真明安达礼为安南将军，同固山额真俄罗塞臣、赛音达理等驻防贵州。
己丑（二十七日），敕谕信郡王多尼、吴三桂、赵布泰等曰：『川、湖、云、贵之人，皆朕臣庶；寇乱以来，久罹汤火。今大兵所至，有归顺者，俱加意安抚，令其得所；能效力建功者，不靳爵禄，以示鼓励。王等即遍行传谕』。
顺治十六年己亥（一六五九）春正月甲午（初二日），四川巡抚高民瞻奏：『伪侯谭文、谭弘、谭诣兄弟叛逆，久居川东。今伊等互相猜忌，谭文方纠党侵犯重庆，谭诣遂杀文来降。我兵乘势掩击，余众奔溃；谭弘亦遣人纳款』。
丁酉（初五日），以徐永祯为右副都御史，巡抚福建（由大理寺卿迁）。
庚子（初八日），初，安远大将军信郡玉多尼、征西大将军平西王吴三桂、征南将军固山额真赵布泰会于平越府之杨老堡，议分兵进取云南：多尼自贵阳入、三桂自遵义入、赵布泰自都匀入，订以十二月会师云南省城。多尼兵至安庄，斩其伪刘将军；追至盘江，贼焚铁锁桥遁，我军作浮桥而济。至松岭卫，伪巩昌王白文选率兵二万拒敌；我军分路进击，大败之，遂进抵云南。三桂兵至七星关，白文选屯兵守险；乃从水西苗猓界间道度关，以袭贼后。贼闻遁去，遂直趋乌撒。赵布泰兵至盘江之罗颜渡口，贼拒险沈船，我军不得渡；投诚土司知府岑继鲁献策，从下流十里取所沈船，乘夜潜师而济，赋仓皇逃溃。梁瑞津有伪伯李成爵屯兵万人于山谷口，我军环山四面夹击，大败贼众，斩获无算。时伪晋王李定国全师据双河口山顶，赵布泰遣兵登山，夺其形胜；贼列象阵来争山，我军合力奋击，大败之，获其象只。至陆格，定国复率三十营贼兵列栅拒守；赵布泰分兵为三队，张左右翼击之，再战俱捷，追四十余里，获象马甚众。时闻贼尚据铁锁桥，乃从普安州间道入云南。三路大师俱入省城，李定国、白文选与伪永历奔永昌。至是，捷闻；上嘉奖之，命所司察叙。
癸卯（十一日），起林天擎为右佥都御史，巡抚云南（降调湖广巡抚）；从经略洪承畴请也。
癸丑（二十一日），以赵廷臣总督云贵、卞三元巡抚贵州（由山西按察使迁）。
二月丁卯（初六日），浙江总督赵国祚奏：『海逆犯温州，官兵击败之，获贼船九十五艘』。命所司察叙。
丙子（十五日），以云南收复，命罗托等班师，以明安达礼驻防贵州。
三月丙申（初五日），调蒋国柱仍以兵部尚书兼右副都御史，巡抚江宁（由操江调）。
戊申（十七日），以朱衣助为右副都御史，督提操江兼巡抚安徽（由陕西右布政使迁）。
浙江巡抚佟国器奏：『海逆犯太平，官兵击败之，斩七百余级，俘获百余』。下所司察叙。
论征福建功，将士升授有差，赠死事者官。
甲寅（二十三日），先是，经略辅臣洪承畴奏：『云南山川峻险，幅员辽阔，非腹里地方可比。请敕议政王、贝勒、大臣密议，三路大兵作何分留驻守？贵州中路汉兵及广西汉兵作何布置安设』？嗣经兵部议：『留拨官兵镇守滇南，事关重大，请旨定夺』。诏议政王，贝勒、大臣会议。至是，王等议：『平西、平南、靖南三藩内，应移一王驻镇云南。汉中已属腹里，兼有四川阻隔，不必藩王驻防；应移一王分镇粤东，一王分镇蜀中。何王应驻何省？恭侯上裁』！奏入，命平西王驻镇云南、平南王驻镇广东、靖南王驻镇四川。
夏四月辛卯朔，贵州总督赵廷臣奏：『逆贼冯天裕等窜伏山寨，句结亡命，先陷湄潭、嗣犯瓮安。臣调思南、平越、遵义、偏桥各路官兵击破贼营，斩天裕及伪总兵冉宗孝等，余党悉平』。
甲寅（二十四日），信郡王多尼、平西王吴三桂、固山额真赵布泰等奏：『臣等追剿伪永历，师至镇南州，闻伪巩昌王白文选拥贼至玉龙关，随遣前锋统领白尔赫图等进剿。白文选拔营先遁，我兵追及，贼复迎战，随击败之；获伪巩昌王金印一颗，生擒伪总兵吕三贵，并获象三只、马一百四十匹。至永平县，贼纵火烧澜沧江之铁锁桥遁去。臣等乘夜发兵渡江，克永昌府；伪永历及李定国遁走腾越州。我兵渡泸江，定国伏兵于磨盘山上木栅内迎敌，我军分为八队冲击。前锋统领白尔赫图等领前锋先登，斩伪伯窦名望；固山额真沙里布继进，伏贼齐发，我兵力战，复败之。贼遁石门，是夜逸去，遂克腾越州。复自腾越州追剿，过南甸、至孟村，贼从三宣六慰路遁去；乃班师回省』。上嘉奖之，命所司察叙。多尼等又奏：『臣等至云南省城，有土司官王耀等二十余员各率所属猓猓村兵丁人口赍伪敕印、诰命、札付投诚』。下所司议叙。
定南王属下梅勒章京总管官兵李茹春奏：『定南王孔有德子廷训，顺治九年失陷桂林时，被逆寇掳去。今入云南访问，已于十五年十二月十六日遭李定国惨害。臣随同平西王吴三桂等赴土主庙迎廷训榇于臣营，容臣扶榇回京』。得旨：『定南王子久陷滇中，尚冀大军克取，来京有日。据奏惨遭逆害，深可悯恻！应行恩恤并扶榇归葬事宜，着速议具奏』。
丁已（二十七日），平西王吴三桂奏：『大兵克滇后，伪庆阳王冯双礼同伪德安侯狄三品等遁走四川建昌卫，臣再三招徕，双礼执迷不从，狄三品等用计执之以献，并缴伪庆阳王金印一颗、大将军金印一颗、金册一、副敕一；冯双礼或俘解来京、或军前正法？伏候上裁』！得旨：『览王奏，计擒伪王冯双礼，具见王筹划周详、指授得宜，豫伐狡谋，克奏肤功；朕心嘉悦！狄三品等遵谕效力，擒逆来献，诚悃可嘉；并敖一凤，俱着从优议叙具奏。冯双礼附逆梗化，大军所至不即投诚，窜迹入蜀，本当正法；但今既就擒，杀之无益。姑免死，昭朕好生之心；着押解来京安置』。三桂又奏：『伪延长伯朱养恩、伪总兵龙海阳、伪副将吴宗秀等为李定国守四川嘉定州，今率众投诚』。下所司察叙。
五月壬戌（初二日），两广总督李栖凤奏：『伪江夏王、伪知府姬玿并贼渠陈奇策等就擒，南宁、太平、思恩等府悉定』。
己已（初九日），偏沅巡抚袁廓宇奏：『武陵县袁梦吉当马逆复犯常德，誓守孤城，被执骂贼死；乞照例恤荫，以慰忠魂』。下所司议。又奏：『故明辅国将军朱儒相投诚』。下所司知之。
壬申（十二日），浙江总督赵国祚奏：『官兵自永嘉、泰顺、青田等处进剿海寇，俱多斩获』。
戊寅（十八日），浙江巡抚佟国器奏：『臣同总督赵国祚、昂邦章京柯魁、梅勒章京夏景梅、提督田雄、水师总兵常进功等统满汉兵追击郑逆，直抵衙前，贼渠奔遁；又败之于定关等处，焚斩甚多』。
辛已（二十一日），谕户、兵二部：『云、贵新入版图，百姓皆朕赤子，念十余年来逆寇李定国等窃踞南服，民久在水火之中困于诛求，生计日匮，疾痛莫告。今大兵所至，群黎归命，欢若更生。但闻两省地方生理未复，室庐残毁、田亩荒芜，俯仰无资，衣食艰窘。朕每念及，不胜悯侧！至南行大兵，阅历险阻，长驱深入，粮饷恐有时不济。今特发内帑银三十万两，尔部即差的当员役克期赍往经略军前，以十五万两赈济两省真正穷民；其十五万两令经略臣收贮，见今进讨三路大兵如有需饷甚急者，立行接济』。
壬午（二十二日），浙江总督赵国祚汇报官兵剿杀郑逆功；得旨：『此奏内准据各官塘报，或称砍死海贼无算、或称打落渰水无算及打坏贼船、打死劫粮贼众动日不可胜计，或称获刀枪、旗牌等物焚毁，或称生擒贼二、三名不等斩讫，俱无的据；着确察议奏。凡各官塘报捷功，必临阵斩获若干？所获马匹器械若干、攻克城池营寨若干？确实有据，始可言功。若泛言斩获及城池夫守、贼去即称恢复，皆系饰词铺张，深为可恶！常见明末行间奏报，辄云杀死无数、获器械无算，掩败为功，相为欺罔，以致误国。今乃仍踵陋习，每多希功请叙。倘沿袭不改，必致贻误封疆。着即通行严饬，以后再有此等奏报者，定治以罔上冒功之罪不贷！兵部知道』。
六月壬子（二十三日），「海寇」陷镇江府。
秋七月丁卯（初八日），命内大臣达素为安南将军，同固山额真索洪、护军统领赖塔等统领官兵征剿「海逆」郑成功。
戊辰（初九日），故明废宗朱义盛谋反，并其党舒瑛、张定之、李勇士、李赞美、谭武周、陈国辅、魏名观、徐介石俱伏诛。
丙子（十七日），「海寇」犯江南省城。
庚辰（二十一日），漕运总督亢得时闻「海寇」入犯江宁，出师高邮，自溺死。
