轩辕在涿鹿平定蚩尤之后，声誉响彻整个人族，成为真正的人皇。
在统一人族的道路上，对于大多数部落，轩辕以仁义折服，而对于那些不服的部落，轩辕则以霸道武力镇压，一一收服，当整个洪荒的人族都被轩辕统治之后，轩辕将人族改称为华夏。并在统治人族九十九年中，著成《黄帝内经》，开创双修之道，完成人皇职责。
轩辕完成人皇职责就意味着传位，而在这些年来，轩辕也已经确认了下届传位人选——颛顼。
禅位大典这次同样在天都城举行，此时的天都经过天、地、人三皇的治理，已经重新成为整个人族的根据地，集政治文化经济为一体，天都城周围一带至黄河以北也称之为中原，人族大多集聚于此，成为人族发展中心。
禅位大典举行这天，祖庙广场外再次聚集了无数人族，人山人海，一眼望不到边际。
在帝天的主持下，人皇轩辕传位于颛顼，完成三皇治世时代。
而轩辕退位之后，功德也如约而至，一片千亩大小的功德祥云从天而降，同样将轩辕的修为提升到混元玄仙(斩三尸至圣）。又有数十道功德落于洪荒各处，被当年相助轩辕的阐截两教真仙所得。
由于广成子为人族的贡献比不上无情、玄都，加上相助轩辕人数太多。因此所得功德却是不及前两位帝师，借助功德也只提升到大罗玄仙顶峰。
轩辕此次证道之后也将崆峒印与轩辕剑(人皇剑)带回祖庙，只将人皇印(崆峒印的分身，可以调动一丝人族气运，保护人皇)传下，自此三皇时代结束，人族步入五帝时代。
自那时起，人皇中非有大功德者，难入祖庙修行，只可享受人间富贵。后人认为神农有火德，故尊其为炎帝；轩辕有土德，尊其为黄帝，后世之人皆以炎黄部落炎黄子孙自称。
辅佐五帝虽有功德，但却远远无法与教导三皇相比，元始天尊也没有再次派遣弟子教导；通天教主却秉着不要白不要的原则，不断派出弟子下界，渐渐在人族中留下了不小的名声。
却说颛顼接任人皇后，号高阳氏，鼓励百姓养殖各种庄稼牲畜以充分利用地力，推算四时节令，以顺应自然，依顺鬼神以制定礼义，理顺四时五行之气以教化万民，洁净身心以祭祀鬼神。
颛顼在位时，还进行了一次重要的宗教改革。曾被轩辕征服的众多小部落，普遍祭拜各种各样的小鬼小神，颛顼强令他们顺从炎黄部落的教化，只祭祀圣帝、三皇等人祖和各位圣人，以及各位人族先贤和镇元子等帮助过人族的大神，取缔了对各类鬼神的祭祀，这一改革促进了各部落之间的融合。
颛顼在位九十九年退位祖庙修行时，在部落中的首领们推举下，高辛继位。
高辛原名帝喾，生于穷桑，生下来极为聪明，自己为自己起的名字叫帝喾，自幼拜金灵圣母为师。
帝喾生来耳聪目明，可以了解远处的情况，可以洞察细微的事理。他顺应上天的意旨，了解下民之所急。
帝喾治民，像雨水浇灌农田一样不偏不倚，遍及天下，凡是日月照耀的地方，风雨所到的地方，没有人不顺从归服。
他的元妃姜原生了弃（即后稷）。弃是周的始祖。次妃简狄生了契。契是商的祖先。次妃庆都生了尧。尧是历史上有名的圣贤之君、五帝之一。次妃常仪生了挚。
帝喾退位以后，其子挚继承帝位，可是帝挚却没什么突出的政绩。帝挚九年，挚亲率官员到唐将帝位禅于尧，尧继帝位，号帝尧。
帝尧与百姓同甘共苦，发展农业，妥善处理各类政务，把天下治理得井井有条，受到百官与普通民众的拥戴。
帝尧继位之初，天文历法还不完善，百姓经常耽误农时，因此尧就根据老师无当圣母的指点。
根据日月的出没、星辰的位次，制定历法，谨慎地教给民众从事生产的节令；根据日月星辰运行等天象和自然物候来推定时日，测定四季；又以月亮一周期为一月，太阳一周期为一年，一年定为三百六十六天，又用置闰月的办法来校正春夏秋冬四季。
帝尧到退位时，与众臣子商议继任者人选，众大臣都推举舜。
舜的家世甚为寒微，自幼拜龟灵圣母为师，虽然是帝颛项的后裔，但五世为庶人，处于社会下层。舜的遭遇更为不幸，父亲瞽叟，是个盲人，母亲很早去世。
瞽叟续娶，继母生弟名叫象。舜生活在“父顽、母嚣、象傲”的家庭环境里，父亲心术不正，继母两面三刀，弟弟桀骜不驯，几个人串通一气，必欲置舜于死地而后快；然而舜对父母不失子道，十分孝顺，与弟弟十分友善，多年如一日，没有丝毫懈怠。
舜在家里人要加害于他的时候，及时逃避；稍有好转，马上回到他们身边，尽可能给予帮助，所以是“欲杀，不可得；即求，尝在侧”身世如此不幸，环境如此恶劣，舜却能表现出非凡的品德，处理好家庭关系。
舜家境清贫，故从事各种体力劳动，经历坎坷。在二十岁的时候，名气就很大了，他是以孝行而闻名的。因为能对虐待、迫害他的父母坚守孝道，故在人族中为人称扬。
于是帝尧便令人将舜找来，让舜参预政事，管理百官，接待宾客，经受各种磨炼。又把自己的两个女儿娥皇、女英嫁给舜，从女儿那里旁敲侧击，考察舜的品性。
舜不但将政事处理得井井有条，而且在用人方面有所改进。经过多方考验，舜终于得到帝尧的认可。选择吉日，举行大典，禅位于舜。
帝舜即位后，重新修订历法，又举行祭祀上帝、祭祀天地四时，祭祀山川群神的大典；还把诸侯的信圭收集起来，再择定吉日，召见各地诸侯君长，举行隆重的典礼，重新颁发信圭。
他即位的当年，就到各地巡守，祭祀名山，召见诸侯，考察民情；还规定以后五年巡守一次，考察诸侯的改绩，明定赏罚，可见舜注意与地方的联系，加强了对地方的统治。
帝舜见尧议事会得成员有鲧、皋陶、契、后稷、伯夷、夔、龙、倕、益、彭祖等，彼此之间无具体分工。
舜根据各人所长，分别委以不同职务：鲧担任司空，主平水土；后稷主持农业，播种百谷；契为司徙，掌管教化；皋陶为司法官，掌刑；倕为共工，主管手工业；益为虞官，掌山林原隰的草木鸟兽；伯夷为秩宗，主管祭祀典礼；夔为曲乐，负责教育贵族子弟；龙为纳言，专门传达舜的命令和转达下情。
帝舜还规定，每三年考核一次官员的政绩，有成绩者加以提拔，不称职者予以撤换。舜设官分职，使官员职守分明，办事效率提高，百业由此兴旺。
帝舜后期，洪荒突发大水，人民苦不堪言，帝尧询问一众大臣道：“汤汤洪水滔天，浩浩怀山襄陵，下民其忧，有能使治者？”
众臣皆曰非鲧不可治，帝尧点头应允，让鲧去治理洪水。
鲧知道帝尧命自己治理水患后笑道：“若欲治好水患却是举手之劳，尧实是大材小用。”众人皆笑之。
鲧自到任后便领着众人开始治理水患，那鲧却是只知堵不知疏，东边有水便堵东边，西边有水便堵西边，如此这般东堵西决。此堵彼溢，鲧忙碌了九年也不曾将水患治理。
帝舜亲自到鲧治水的地方去考察，发现鲧治水不力，便将鲧斩杀于羽山，以惩罚他没有治理好水患，并接受众人的建议，派鲧的儿子大禹继续治理水患。
禹为鲧之子，姓姒氏，又名文命，字高密。生于西羌，后随父迁徙于崇，尧时被封为夏伯，故又称夏禹或伯。
大禹在得到任命后，便立即与益和后稷一起视察河道，召集天下百姓前来协助。他检讨鲧失败的原因，决定改革治水方法，变堵截为疏导，亲自翻山越岭，淌河过川，拿着工具，从西向东，一路测度地形的高低，树立标杆，规划水道。并且为了治水，到处奔波，三次经过自己的家门，都没有进去。
第一次，妻子生了病，没进家去看望。第二次，妻子怀孕了，没进家去看望。第三次，他妻子涂山氏生下了儿子启，婴儿正在哇哇地哭，禹在门外经过，听见哭声，也忍着心没进去探望。
大禹改变了他父亲的做法，逢山开山，遇洼筑堤，要将洪水引入大海。禹为了治水，费尽脑筋，不怕劳苦，从来不敢休息，可大禹要面对的不仅是洪水和高山，更有伴随大水而来各种精怪。
